Fitting 3D deformable biological models to microscope images = Alinhamento de modelos tridimensionais usando imagens de microscopia
Danillo Roberto Pereira
TESE
Inglês
T/UNICAMP P414f
[Alinhamento de modelos tridimensionais usando imagens de microscopia]
Campinas, SP : [s.n.], 2013.
104 p. : il.
Orientador: Jorge Stolfi
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação
Resumo: Nesta tese descrevemos um algoritmo genérico (que denominamos MSFit) capaz de estimar a pose e as deformações de modelos 3D de estruturas biológicas (bactérias, células e etc.) em imagens obtidas por meio de microscópios óticos ou de varredura eletrônica. O algoritmo usa comparação...
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Resumo: Nesta tese descrevemos um algoritmo genérico (que denominamos MSFit) capaz de estimar a pose e as deformações de modelos 3D de estruturas biológicas (bactérias, células e etc.) em imagens obtidas por meio de microscópios óticos ou de varredura eletrônica. O algoritmo usa comparação multi-escala de imagens utilizando uma métrica sensível ao contorno; e um método original de otimização não-linear. Nos nossos testes com modelos de complexidade moderada (até 12 parâmetros) o algoritmo identifica corretamente os parâmetros do modelo em 60-70% dos casos com imagens reais e entre 80-90% dos casos com imagens sintéticas
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Abstract: In this thesis we describe a generic algorithm (which we call MSFit) able to estimate the pose and deformations of 3D models of biological structures (bacteria, cells, etc.) with images obtained by optical and scanning electron microscopes. The algorithm uses an image comparison metric...
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Abstract: In this thesis we describe a generic algorithm (which we call MSFit) able to estimate the pose and deformations of 3D models of biological structures (bacteria, cells, etc.) with images obtained by optical and scanning electron microscopes. The algorithm uses an image comparison metric multi-scale, that is outline-sensitive, and a novel nonlinear optimization method. In our tests with models of moderate complexity (up to 12 parameters) the algorithm correctly identifies the model parameters in 60-70 % of the cases with real images and 80-90 % of the cases with synthetic images
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Stolfi, Jorge, 1950-
Orientador
Figueiredo, Luiz Henrique de
Avaliador
Piteri, Marco Antônio
Avaliador
Gomide, Anamaria, 1949-
Avaliador
Pedrini, Hélio, 1963-
Avaliador
Fitting 3D deformable biological models to microscope images = Alinhamento de modelos tridimensionais usando imagens de microscopia
Danillo Roberto Pereira
Fitting 3D deformable biological models to microscope images = Alinhamento de modelos tridimensionais usando imagens de microscopia
Danillo Roberto Pereira
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