816 registros encontrados - programa Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular
Bajay, Stephanie Karenina, 1989-
TESE - Inglês
Número de chamada: T/UNICAMP B167a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2022.
Assunto: Genômica
Resumo: A seleção de genótipos superiores, através da aplicação de seleção genômica (SG) e estudos de associação genômica ampla (GWAS), melhoraram...
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Resumo
Resumo: A seleção de genótipos superiores, através da aplicação de seleção genômica (SG) e estudos de associação genômica ampla (GWAS), melhoraram drasticamente a velocidade e a escala da genética aplicada no melhoramento florestal. No entanto, a escolha da melhor metodologia a ser adotada varia de acordo com os objetivos a serem alcançados em cada etapa de desenvolvimento do programa de melhoramento. A SG é uma excelente estratégia a ser adotada nas fases iniciais e intermediária de programas de melhoramento, para a seleção de genótipos superiores. Nos últimos anos, os esforços para o melhoramento de espécies perenes se voltaram para a SG, pois ela deve permitir que a maioria das fontes de variação para características complexas sejam rastreadas. Neste contexto de SG, também vem se destacando a incorporação de métodos avançados de aprendizado de máquina, devido ao fato destes algoritmos permitirem treinamento usando representação de dados mais complexos e por não exigirem pressuposições quanto ao modelo. Dentre os vários métodos de aprendizado existentes, a seleção de atributos foi o escolhido para estudo na presente tese. A seleção de atributos permite a redução da densidade de marcadores e construção de modelos simples e abrangentes de predição, evitando a atribuição de efeitos não genéticos aos marcadores e aumentando o poder preditivo dos fenótipos de interesse. Complementarmente à SG, com o objetivo de ampliar o entendimento da arquitetura e base genética dos fenótipos estudados, também foi adotada a estratégia de estudo quantitativo da interação genótipo-fenótipo através do GWAS. Para a interpretação de como os genes descobertos por GWAS e SG influenciam nas características analisadas, foram adotadas estratégias de anotação de vias genéticas e ontologias identificadas com transcriptomas. Redes de co-expressão gênica foram construídas, com intuito de desenvolver uma compreensão global da expressão gênica e função biológica possivelmente correlacionada com os genes candidatos a modulação dos fenótipos de interesse. A combinação de diferentes estatísticas e análises genômicas, como SG, aprendizado de máquina, GWAS e redes de co-expressão gênica, se torna uma estratégia promissora para que seja possível lidar efetivamente com o melhoramento de caracteres complexos. Desta forma, o objetivo central da tese que se apresenta foi integrar múltiplas análises ômicas: SG, GWAS, ML e rede de co-expressão gênica para seleção de genótipos superiores em espécies arbóreas
Ação in vitro o laser hélio-neônio sobre o fungo Paracoccidioides brasiliensis
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP D569a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2012.
Assunto: Laser helio-neonio
Resumo: A paracoccidioidomicose (PCM), uma micose sistêmica, cujo agente etiológico é o fungo Paracoccidioides brasiliensis, acomete primariamente os...
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Resumo
Resumo: A paracoccidioidomicose (PCM), uma micose sistêmica, cujo agente etiológico é o fungo Paracoccidioides brasiliensis, acomete primariamente os pulmões e pode causar lesões secundárias na pele e mucosas, que são extremamente dolorosas e de difícil tratamento por métodos convencionais com drogas anti-fúngicas. Estudos anteriores, conduzidos em nosso laboratório, usando modelos experimentais para PCM, mostraram a capacidade do laser HeNe em aumentar a produção de citocinas pró-inflamatórias e a síntese de fibras colágenas, reticulina e de elementos de matriz extracelular, como laminina e fibronectina. Estes eventos levaram a uma cicatrização tecidual mais rápida e eficaz das lesões. Além disso, as células fúngicas recuperados a partir das lesões após tratamento com laser mostrou nenhuma capacidade de crescimento, quando cultivadas in vitro. Neste trabalho foi avaliada a ação direta do laser HeNe sobre o fungo com o objetivo de fornecer suporte para o uso desta terapia durante a infecção PCM. Os resultados mostraram que o tratamento com laser de HeNe reduziu a capacidade de crescimento e a viabilidade de células fúngicas em 90% e 30%, respectivamente. Ademais, as células tratadas apresentaram núcleo mais eletrondenso, sugerindo que a irradiação com laser induz alterações ultra-estruturais que podem afetar a viabilidade e/ou a virulência do fungo. Entretanto, a patogenicidade do fungo não foi afetada, uma vez que nenhuma diferença foi observada no pulmão de animais infectados com o fungo tratado e não tratado. Além dos efeitos sobre a resposta inflamatória, acreditamos que o laser de HeNe modifica, ou mesmo destrói, estruturas que são usadas pelo patógeno como mecanismos de resistência. Certamente, esta atividade fungistática/fungicida do laser também desempenha um papel importante na aceleração da cicatrização de feridas e, deste modo, a terapia com o laser de HeNe pode ser considerada como um tratamento adjuvante na cura de lesões da pele observados durante PCM
BCCL (1)
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP M616a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2019.
Assunto: Fatores reguladores de interferon
Resumo: O sistema de interferon (IFN) é filogeneticamente antigo e desempenha papel essencial na resposta contra vírus, uma vez que ele é capaz de...
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Resumo
Resumo: O sistema de interferon (IFN) é filogeneticamente antigo e desempenha papel essencial na resposta contra vírus, uma vez que ele é capaz de controlar a maioria das infecções virais, mesmo na ausência da imunidade adaptativa. Os fatores celulares que medeiam essa defesa são produtos de genes estimulados por Interferon (ISGs). Embora centenas de ISGs tenham sido identificados desde sua descoberta há mais de 25 anos, ainda não sabemos quais genes são essenciais para o controle de arbovírus emergentes brasileiros, como o vírus Oropouche (OROV). OROV é prevalente em toda região Amazônica, associado com quadros clínicos debilitantes, que podem variar desde quadros febris-exantemáticos até quadros graves, com acometimento neurológico. Assim, a compreensão das complexas interações entre OROV e seus hospedeiros serão cruciais para determinação dos fatores patogenéticos associados com o desenvolvimento de doenças graves, assim como para o desenvolvimento de estratégias de controle. Desse modo, analisamos o papel de 12 ISGs (IFIT1, IFITM1, IFIT2, IFITM2, IFIT3, IFITM3, IFIT5, ADAR, IRF1, LY6E, ISG20 e BST2) no controle da infecção por OROV a nível celular. Para isso, Citometria de Fluxo (FACS) foi aplicada para quantificar a taxa de infecção por OROV em células geneticamente modificadas que superexpressavam esses 12 ISGs. Para tanto, células de linhagem humana (HT1080) foram transduzidas com uma minibiblioteca de vetores lentivirais expressando ISGs e infectadas com OROV. Os dados demonstraram que alguns ISGs podem ser essenciais no controle do OROV, visto que a superexpressão desses genes diminuiu significantemente a taxa de infecção por esse vírus. Particularmente, LY6E apresentou resultados mais promissores, pois a inibição da infecção por OROV foi acompanhada do aumento significativo da expressão desse gene após transdução com o vetor lentiviral. Desta forma, esse estudo fornece a primeira evidência do papel de LY6E na restrição da replicação de OROV. Estudos mais aprofundados são necessários para entender o papel do produto desse gene e do polimorfismo inerente a ele no controle ou desenvolvimento de doença por esse importante arbovírus emergente brasileiro
ACC sintase em cana-de-áçucar = estudos de regulação gênica e aplicação biotecnológica
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP T197a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2011.
Assunto: ACC sintase
Resumo: A cultura da cana-de-açúcar (Saccharum spp) está entre as mais importantes do Brasil, tendo o setor sucroalcooleiro grande importância...
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Resumo
Resumo: A cultura da cana-de-açúcar (Saccharum spp) está entre as mais importantes do Brasil, tendo o setor sucroalcooleiro grande importância econômica no país devido ao crescente consumo de álcool e açúcar. A fase de maturação no desenvolvimento da cana-de-açúcar é especialmente interessante, pois está diretamente relacionada com o teor de sacarose. O hormônio etileno está envolvido em muitos aspectos do ciclo de vida da planta, incluindo a maturação. Como primeira parte deste projeto, o objetivo foi avaliar a relação entre etileno e maturação de cana-de-açúcar pela caracterização da expressão dos genes que codificam as isoformas da enzima ACC sintase, responsável por uma das vias da biossíntese desse hormônio. Assim, dois genes (Scacs1 e Scacs2) que codificam para a enzima ACC sintase foram identificados no projeto SUCEST e caracterizados. Nossos resultados de localização subcelular confirmaram estudos anteriores sobre a localização citoplasmática das proteínas ACS. Todavia, nós identificamos por análise in silico a presença de um peptídeo sinal na região N-terminal da proteína ScACS2. Ensaios de duplo-híbrido com bibliotecas de cDNAs a partir de tecidos de folha +1 e entrenó 5, nos revelaram novas interações putativas com a proteína ScACS2, sendo uma delas, a proteína denominada sinaptotagmina envolvida no mecanismo de reparo da membrana celular. Ao contrário do que foi observado em Arabidopsis, nossos resultados de heterodimerização não identificaram uma interação entre as isoformas de cana-de-açúcar. Análise de expressão por PCR quantitativo em duas variedades contrastantes ao teor de sacarose, identificaram uma maior expressão nos entrenós madurados quando comparados aos entrenós jovens para os dois genes ACS. Em uma estudo in situ da expressão, o gene Scacs1 apresentou uma expressão nas células do parenquima e nas células da bainha do feixe vascular, entretanto, não mostrou expressão nos feixes vasculares. Por outro lado, o gene Scacs2 apresentou expressão constitutiva nos diferentes tipos celulares e, inclusive, nos feixes vasculares. Os resultados apresentados nesse trabalho, abrem novas perspectivas e perguntas para os diversos mecanismos fisiológicos e celulares realizados pelo hormônio etileno nas plantas. Todavia, uma prática comum antes da colheita da cana é a aplicação de precursores do hormônio etileno, como o etefon (ácido 2-cloroetil fosfônico) para acelerar o amadurecimento final das plantas, inibir o florescimento e consequentemente aumentar o teor de sacarose. Assim, a manipulação da biossíntese desse hormônio tem o potencial para aumentar a produtividade em cana. Desta forma, um segundo objetivo deste projeto foi desenvolver uma estratégia para promover o amadurecimento controlado da cana-de-açúcar no final da safra, usando o etanol em substituição aos análogos químicos do etileno. Para tal, foi avaliado o uso de um promotor ativado por etanol (sistema de expressão alc de Aspergillus nidulans) controlando a expressão do gene que codifica a ACC sintase, enzima chave na biossíntese de etileno. Nossos resultados foram condizentes com o esperado, mostrando claramente um aumento na produção do hormônio etileno quando plantas transgênicas de tabaco foram induzidas por spray foliar com 5% (v/v) de etanol. Esses resultados demonstram a possível utilização de ferramentas biotecnológicas no controle da expressão de genes envolvidos em características agrícolas interessantes, tais como na cultura de cana-de-açúcar.
BCCL (1)
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP AL64a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2004.
Assunto: Imuno-histoquímica - Diagnóstico
Resumo: O Vírus Respiratório Sincicial Bovino (BRSV) é o agente etiológico de infecções respiratórias amplamente distribuídas e que produzem perdas...
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Resumo
Resumo: O Vírus Respiratório Sincicial Bovino (BRSV) é o agente etiológico de infecções respiratórias amplamente distribuídas e que produzem perdas importantes na criação comercial de bovinos. A infecção pelo BRSV produz alterações patológicas como bronquiolite e pneumonia intersticial e acomete, sobretudo, animais jovens. A limitada multiplicação do
vírus em cultivos celulares e a sua instabilidade, representam dificuldades durante os procedimentos de isolamento do BRSV a partir de amostras clínicas. O presente trabalho teve
como objetivo padronizar técnicas rápidas, sensíveis e específicas para a detecção do BRSV, utilizando um isolado brasileiro. Para tanto, foram utilizados camundongos Balb/c como
modelo de infecção experimental pelo BRSV, a partir dos quais o vírus foi detectado pelas técnicas de RT-nested-PCR e imuno-histoquímica (IHQ) e os resultados foram comparados
com aqueles obtidos em bovinos infectados experimentalmente. A técnica de RT-nested-PCR mostrou-se mais sensível para detecção do BRSV do que a técnica de IHQ, tanto para tecidos murinos quanto bovinos. As técnicas foram utilizadas em tecidos de bovinos suspeitos de infecção por BRSV. Uma destas amostras apresentou resultado positivo no RT-nested-PCR e na IHQ. O seqüenciamento dos produtos de PCR deste vírus detectado foi realizado. Esta nova estirpe, juntamente com a descrita previamente BRSV-25-BR (único isolado presente até então no Brasil), é representante do subgrupo B do BRSV e constitui importante ferramenta para a avaliação do perfil dos isolados brasileiros de BRSV, estimar a origem destes isolados e redefinir as necessidades locais com relação ao conteúdo das vacinas. As técnicas de RTnested- PCR e IHQ padronizadas serão úteis em estudos epidemiológicos bem como, no diagnóstico laboratorial do BRSV no Brasil
vírus em cultivos celulares e a sua instabilidade, representam dificuldades durante os procedimentos de isolamento do BRSV a partir de amostras clínicas. O presente trabalho teve
como objetivo padronizar técnicas rápidas, sensíveis e específicas para a detecção do BRSV, utilizando um isolado brasileiro. Para tanto, foram utilizados camundongos Balb/c como
modelo de infecção experimental pelo BRSV, a partir dos quais o vírus foi detectado pelas técnicas de RT-nested-PCR e imuno-histoquímica (IHQ) e os resultados foram comparados
com aqueles obtidos em bovinos infectados experimentalmente. A técnica de RT-nested-PCR mostrou-se mais sensível para detecção do BRSV do que a técnica de IHQ, tanto para tecidos murinos quanto bovinos. As técnicas foram utilizadas em tecidos de bovinos suspeitos de infecção por BRSV. Uma destas amostras apresentou resultado positivo no RT-nested-PCR e na IHQ. O seqüenciamento dos produtos de PCR deste vírus detectado foi realizado. Esta nova estirpe, juntamente com a descrita previamente BRSV-25-BR (único isolado presente até então no Brasil), é representante do subgrupo B do BRSV e constitui importante ferramenta para a avaliação do perfil dos isolados brasileiros de BRSV, estimar a origem destes isolados e redefinir as necessidades locais com relação ao conteúdo das vacinas. As técnicas de RTnested- PCR e IHQ padronizadas serão úteis em estudos epidemiológicos bem como, no diagnóstico laboratorial do BRSV no Brasil
BCCL (1)
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP M366a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2006.
Assunto: Adenovirus
Resumo: O tratamento de esgoto sanitário em lagoa de decantação anaeróbia e disposição controlada de água residuária no solo é uma alternativa de...
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Resumo
Resumo: O tratamento de esgoto sanitário em lagoa de decantação anaeróbia e disposição controlada de água residuária no solo é uma alternativa de baixo custo para o reuso de águas residuárias na agricultura. Nele, o esgoto sanitário é depositado em uma lagoa de decantação anaeróbia com retenção hidráulica de sete dias, após o que a água residuária é conduzida para rampa de solo franco argilo-arenoso, com cobertura vegetal de gramínia Cynodon sp, para disposição por escoamento superficial, seguindo-se sua infiltração e percolação. O objetivo desse trabalho foi verificar a eficiência desse sistema na eliminação e/ou inativação de adenovírus humanos (HAdV) e rotavírus (RV). Amostras de 1L de água residuária foram obtidas em quatro coletas, em intervalos de sete dias, na entrada do esgoto bruto (EB), no ponto de aplicação na rampa (0m) e nos pontos da sua superfície após 10, 20, 30, 35m e 40m. Sob a rampa, a 1m de profundidade e distantes 30m (30-1) e 35m (35 -1), dois pontos foram amostrados. Antes do ponto 0m, pontos de testemunha a 1m de profundidade e distantes 2m (T1) e 0,5m (T2) da rampa, e um ponto do lençol freático (LF) a 3m de profundidade, também foram coletados.As água residuárias foram concentradas de 1.000 a 5.000 vezes por filtração e eluição em membrana eletropositiva e ultracentrifugação. Nos eluatos obtidos, após extração de DNA, a presença de HAdV foi pesquisada por PCR e nested-PCR. Para a detecção de RV usou-se RT-PCR e duplo-semi- nested-PCR. Eluatos HAdV positivos foram inoculados em células HEp-2 e após até cinco passagens a presença de HAdV foi confirmada por PCR.. HAdV foram detectados em 29 das 35 amostras analisadas, sendo positivos todos os pontos de EB e da superfície da rampa. Em profundidade, sob a rampa, quatro amostras foram positivas, além de outras duas em T2 e uma em LF, o que demonstra a percolação desses vírus no solo com contaminação do LF. Quando testadas em células HEp-2, nas amostras do EB e dos pontos 0, 30, 35 e 40m a presença de vírions foi determinada, enquanto nos pontos 30-1m e LF os HAdV não foram infectivos. Esses resultados permitem concluir que o sistema não foi eficiente para remover e/ou inativar HAdV. Por outro lado, pode-se afirmar que os HAdV são indicadores virais adequados para esse sistema, desde que mantida a metodologia aqui empregada. Uma amostra de EB foi positiva para RV (genotipos G1 e G2), resultado esse que não permite qualquer conclusão. Para o reuso da água residuária advinda desse sistema impõe-se a associação de processos de desinfecção para a eliminação de HAdV
BCCL (1)
Aeromonas sp : incidencia em alimentos e estudo de caracteristicas associadas a virulencia
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP R618a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 1992.
Assunto: Imunologia
Resumo: Não informado
BCCL (1)
Salgueiro, Willian Goulart, 1993-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP Sa32h
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2020.
Assunto: Colesterol
Resumo: O colesterol é essencial para diversos processos fisiológicos, principalmente por sua função estrutural e como precursor de uma ampla gama de...
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Resumo
Resumo: O colesterol é essencial para diversos processos fisiológicos, principalmente por sua função estrutural e como precursor de uma ampla gama de sinalizadores endócrinos. No entanto, o consumo excessivo de uma dieta ocidental, a qual é rica em colesterol, pode levar à obesidade diferentes dislipidemias, o que resulta em um risco elevado para doenças metabólicas e cardiovasculares. Além disso, há um crescente montante de evidências sugerindo que pais com distúrbios metabólicos, incluindo aqueles que envolvem um excesso de colesterol, podem gerar descendentes com alterações provenientes de tais doenças, mesmo que estes nunca tenham tido contato com os fatores causais destas. Tal possibilidade é preocupante, pois propiciaria a perpetração de efeitos possivelmente deletérios por gerações através de mecanismos epigenéticos. Visto que a pesquisa básica nessa área pode ser limitada pelo custo e tempo envolvidos com o uso de mamíferos e seus longos tempos de geração, o nematoide C. elegans surge como uma alternativa viável. Esse invertebrado não sintetiza colesterol e por isso seus níveis podem ser controlados essencialmente pela oferta dietética. Além disso, possui ortologia suficiente com mamíferos para que se formulem hipóteses por vezes extrapoláveis para organismos mais complexos. Ainda, pelo curto tempo de vida e geração, C. elegans são ideais para a condução de estudos que envolvam várias gerações. Aqui nós mostramos que C. elegans expostos a uma concentração alta de colesterol (50 µM; 20 µg/mL) em P0 apresentam diversos fenótipos alterados e herdáveis pela geração F1. O fenótipo de desenvolvimento acelerado é devido à maior expressão de vitelogenina, sobretudo de vit-2/YP170B. Nossos dados sugerem que miRNAs regulam positivamente a expressão de vit-2 em P0 e F1, o que é suficiente para fenocopiar a exposição aos altos níveis de colesterol. Nós sugerimos que miRNAs da família dos let-7 (let-7-fam) regulam a expressão de vit-2/YP170B, provavelmente de forma indireta, ocasionando uma maior oferta de vitelo para a progênie, onde possivelmente algum elemento carregado por este complexo reinicia o ciclo de expressão do mesmo fenótipo, incluindo expressão de miRNAs let-7-fam e vit-2/YP170B. Nossos resultados apontam para uma relação ainda não demonstrada entre uma maior oferta de colesterol e a regulação da expressão de vitelogênese por miRNAs de maneira intergeracional
Souza, Érica Martinha Silva de, 1989-
TESE - Inglês
Número de chamada: T/UNICAMP So89h
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2022.
Assunto: Evolução
Resumo: Os peixes-boi possuem três espécies viventes: T. manatus (Costa da América do Norte, Central e parte do Sul), T. inunguis (endêmico da Bacia...
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Resumo
Resumo: Os peixes-boi possuem três espécies viventes: T. manatus (Costa da América do Norte, Central e parte do Sul), T. inunguis (endêmico da Bacia Amazônica), e T. senegelensis (Costa da República do Congo). Essas espécies têm sido estudadas durante as últimas décadas em relação a seus aspectos ecológicos (comportamento, hábitos, locomoção), fisiológicos (equilíbrio de osmorregulação, trato gastroinestinal) e também do ponto de vista da genética de populações. O presente trabalho apresenta análises comparativas inéditas do ponto de vista genômico para as três espécies, utilizando sequenciamento completo do genoma mitocondrial (para as três espécies) e nuclear (para as espécies brasileiras). A tese está dividida em dois capítulos em forma de artigo científico, sendo um já publicado. O primeiro capítulo utiliza o genoma mitocondrial das três espécies viventes de peixe-boi para inferirmos sobre a história evolutiva do gênero, ainda, testamos alguns genes mitocondriais sob seleção que estão relacionados à respiração celular. No segundo capítulo, analisamos o genoma das espécies de peixe-boi encontradas no Brasil, T. manatus e T. inunguis, utilizamos a plataforma Hi-Seq 2500 e quatro lanes de bibliotecas paired-end, e duas para mate- pair, para atingir a cobertura de 80X. Foram realizadas análises de qualidade dos genomas e montagem, além de análises comparativas sobre a quantidade de elementos repetitivos, grupos ortólogos, expansão e retração de famílias gênicas, e análises demográficas. As análises nos mostraram expansão e retração em algumas famílias gênicas relacionada à receptores olfativos, verificamos também a quantidade de elementos exclusivos para ambas as espécies. Sobre a história demográfica das espécies verificamos que em alguns momentos quando havia aumento do Ne em uma população, a outra sofria com redução de seu Ne. Em suma, os dois capítulos geram importantes dados que podem ser utilizados como base para estudos posteriores em relação à essas espécies
Monte-Bello, Carolina Cassano, 1987-
TESE - Multilíngua
Número de chamada: T/UNICAMP M764i
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2018.
Assunto: Crescimento (Plantas)
Resumo: O crescimento e o desenvolvimento vegetal são mantidos por uma complexa rede controlada por fatores ambientais incluindo a disponibilidade de...
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Resumo
Resumo: O crescimento e o desenvolvimento vegetal são mantidos por uma complexa rede controlada por fatores ambientais incluindo a disponibilidade de nutrientes, água e luz, e por diversas vias de sinalização que interagem entre si. Uma das principais vias que exerce papel fundamental na regulação do crescimento celular em eucariotos é a quinase "Target Of Rapamycin" (TOR). Em plantas, várias linhas de evidência apontam que a TOR desempenha uma função crucial no balanço entre carbono e nitrogênio, atuando como um regulador do metabolismo central controlando o crescimento e a produção de biomassa. Apesar disso, pouco se conhece sobre seu modo de ação em plantas. Para investigar a participação da TOR no controle do metabolismo, plântulas de Arabidopsis thaliana em fase inicial de desenvolvimento receberam tratamento com o inibidor químico da TOR, AZD-8055, e foram analisadas através de perfis metabólicos em larga escala (GC-TOF-MS e LC-MS/MS) combinados com análises enzimáticas ao longo do ciclo diuturno. As respostas metabólicas da inibição dessa via a curto prazo ampliaram as evidências de uma forte regulação do metabolismo primário. A repressão desta via em períodos específicos do ciclo diuturno permitiu elucidar que o fenótipo de acúmulo de amido ocorre graças à redução da degradação em períodos definidos do dia (primeiras e últimas horas de luz). Por outro lado, os baixos teores de sacarose não permitem comprovar que a inibição do complexo TOR apenas leve à diminuição da demanda de carbono para o crescimento. Ao contrário, a repressão desta via desacopla a percepção e sinalização de açúcares, indicando que o complexo TOR não apenas é afetado pelos níveis destes metabólitos, mas também atua em sua regulação. Um exemplo é a quebra da sólida relação entre sacarose e seu açúcar sinalizador trealose-6-fosfato (Tre6P) por mecanismo ainda não elucidado. Os resultados obtidos nessa tese expõem pela primeira vez a interação entre TOR e Tre6P, indicando um papel importante desta via em perceber os níveis de nutrientes para ajustar o crescimento vegetal
De Siqueira, Mirian Krystel, 1992-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP D46a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2019.
Assunto: Infecções por Yersinia pseudotuberculosis
Resumo: Infecções em tecidos de barreira, como pele, pulmões e intestino, representam uma ocorrência frequente em todo o mundo. No entanto, os...
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Resumo
Resumo: Infecções em tecidos de barreira, como pele, pulmões e intestino, representam uma ocorrência frequente em todo o mundo. No entanto, os mecanismos subjacentes às consequências a longo prazo dos episódios agudos de infecção para a fisiologia do hospedeiro permanecem pouco explorados. Em particular, a infecção na mucosa intestinal pode alterar a composição da microbiota e interferir na maneira como o hospedeiro responde as alterações ambientais, incluindo mudanças na dieta e na exposição a patógenos. No presente trabalho, relatamos como um único episódio de infecção gastrointestinal aguda pode alterar a fisiologia do hospedeiro, contribuindo para uma melhora metabólica e conferir uma vantagem ambiental. Após a eliminação da infecção por Yersinia pseudotuberculosis (YP), detectamos uma inflamação caracterizada por TNF, IL-1beta e IL-6 em vários compartimentos do tecido adiposo branco (AT). Essa inflamação crônica estava associada ao aumento da permeabilidade dos vasos linfáticos intestinais e de um extravasamento de quilomícrons. Apesar da intensa perda de lipídios da dieta, os camundongos apresentaram aumento de peso e um remodelamento persistente dos compartimentos de tecido adiposo branco. Paradoxalmente, apesar do ganho de peso e da expansão do tecido adiposo, os camundongos apresentaram uma melhor tolerância à glicose e uma maior sensibilidade à insulina. A análise do gasto energético demonstrou que os animais previamente infectados apresentam um melhor metabolismo de carboidratos. Tal alteração metabólica para o uso de carboidratos foi dependente da microbiota e conferiu ao hospedeiro uma resistência à desnutrição. Análises genômicas da porção 16S da microbiota intestinal revelou um aumento de Proteobacteria, em particular de Suterella wadworthensis (SW), que é mantido após a eliminação da infecção. Notavelmente, o transplante de Suterella em camundongos jovens ou germ-free melhorou o metabolismo de glicose e aumentou a secreção de peptídeo insulinotrópico dependente de glicose (GIP). Portanto, este estudo propõe que mudanças na microbiota induzidas por um episódio de infecção gastrointestinal aguda podem causar uma vantagem metabólica para o hospedeiro, uma resposta que pode ser essencial a sobrevivência em regiões onde há prevalência de infecções gastrointestinais e desnutrição
Alterações mitocondriais e nucleares associadas à neuropatia óptica
Miranda, Paulo Maurício do Amôr Divino, 1982-
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP M672a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2014.
Assunto: Doenças do nervo óptico
Resumo: A Neuropatia Óptica Hereditária de Leber (LHON) e a Atrofia Óptica Autossômica Dominante (ADOA ou OPA1) são doenças caracterizadas pela perda...
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Resumo
Resumo: A Neuropatia Óptica Hereditária de Leber (LHON) e a Atrofia Óptica Autossômica Dominante (ADOA ou OPA1) são doenças caracterizadas pela perda da visão bilateral, devido a uma degeneração do nervo óptico. Ambas as doenças apresentam também acuidade visual reduzida, discromatopsia, palidez do nervo óptico e escotoma central ou centrocecal. A LHON é causada por mutações no DNA mitocondrial (mtDNA), onde três dessas mutações representam 95% dos casos (mutações primárias principais G11778A, T14484C e G3460A) e as mutações subsequentes representam apenas 5% do total (mutações raras). A ADOA é causada por mutações (mais de 300) no gene nuclear OPA1. Embora os mecanismos moleculares precisos envolvidos no desenvolvimento das duas doenças ainda não são bem compreendidos, foi demonstrado que LHON e ADOA possuem um defeito comum de acoplamento da fosforilação oxidativa. Nesses dois casos, a hipótese é de que as mutações no mtDNA e no gene OPA1 afetariam a integridade mitocondrial, resultando em uma diminuição do fornecimento de energia para os neurônios do nervo óptico. É possível que no Brasil a presença e frequência das alterações da relacionadas à LHON e ADOA sejam diferentes das encontradas em outras partes do mundo. Por isso, o presente estudo teve como principais objetivos rastrear mutações e haplogrupos associadas à LHON e detectar mutações no gene OPA1 em pacientes brasileiros com hipótese diagnóstica de LHON e com Neuropatia Óptica de etiologia a esclarecer. Também foi objetivo otimizar o método de PCR Multiplex Alelo-Específico e padronizar as plataformas de alto rendimento TaqMan® OpenArray® e Iplex Gold/Maldi TOF MS para o rastreamento da LHON. Foram avaliados 101 pacientes, sendo 67 com hipótese diagnóstica de LHON e 34 com neuropatia óptica de etiologia a esclarecer. As mutações da LHON foram detectadas por meio de PCR-RFLP e PCR Multiplex Alelo-Específico. As mutações raras da LHON e do gene nuclear OPA1 (10 principais éxons) foram rastreadas por sequenciamento direto. Foram encontradas mutações da LHON em 36 casos (83.3% com a mutação G11778A e 16.7% com a mutação T14484C). Não foi encontrada a mutação G3460A. Também não foram encontradas mutações raras da LHON e nem mutações relacionadas à ADOA. Haplogrupos de origem africana (L1/L2 e L3) foram mais frequentes no estudo. Foi otimizado o método de PCR Multiplex Alelo-Específico e padronizadas as plataformas TaqMan® OpenArray® e Iplex Gold/Maldi TOF, os quais se mostraram reprodutivos, eficientes e eficazes. A análise molecular das mutações da LHON e do OPA1 foi importante para a confirmação do diagnóstico de 35% dos casos clínicos típicos de LHON e para a elucidação 35% casos de neuropatia óptica de etiologia a esclarecer
BCCL (1)
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP As76a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2007.
Assunto: Telangiectasia hemorrágica hereditária
Resumo: A Telangiectasia Hemorrágica Hereditária (THH) é uma desordem autossômica dominante caracterizada por epistaxe recorrente, telangiectases...
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Resumo
Resumo: A Telangiectasia Hemorrágica Hereditária (THH) é uma desordem autossômica dominante caracterizada por epistaxe recorrente, telangiectases mucocutânea, hemorragia gastrointestinal, e malformação arteriovenosa pulmonar (PAVM), cerebral e hepática. A prevalência da doença é de 1/5000 e a mortalidade relatada da doença entre pacientes jovens quando comparado com aqueles com mais de 60 anos é de 36%. Dois genes da superfamília de receptores para TGF-? têm sido relacionados com THH, o gene da endoglina e o gene da activina (activin receptor-like-kinase). Estes genes são altamente expressos em células endoteliais e outros tecidos altamente vascularizados como pulmão e placenta. Mutações no gene da endoglina causam a THH tipo 1 que é caracterizada pela alta incidência de malformação arteriovenosa pulmonar sintomática (PAVMs). Mutações no gene da activina levam a THH tipo 2 caracterizada por epistaxe recorrente e malformação arteriovenosa gastrointestinal. Foi objetivo deste trabalho realizar uma triagem de mutações na região codificadora dos genes ALK-1 e endoglina em doze pacientes portadores de THH atendidos no Hemocentro da Unicamp. A abordagem metodológica incluiu a amplificação dos exóns dos genes da activina e endoglina seguida pela técnica de PCR/CSGE, clonagem e sequenciamento. Dos doze pacientes estudados, sete apresentaram alguma alteração molecular, destes três pacientes apresentaram uma deleção de um nucleotídeo T na posição 913 no exon 7, um paciente apresentou uma inserção de um nucleotídeo G na posição 204-205 no exon 3 e três pacientes apresentavam uma mutação misense nos exons 7 e 8 na posição 976 e 1204 respectivamente. Nossos resultados mostraram que a THH tipo 1 e tipo 2 são raras no Brasil e todas as mutações citadas na tabela IV e Figura 10 são novas, somente a mutação ocorrida no exon 8 foi previamente descrita na literatura
BCCL (1)
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP B294a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2000.
Assunto: Anemia hemolitica
BCCL (1)
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP M828a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2019.
Assunto: Envelhecimento
Resumo: A expressão global de microRNAs (miRNAs) diminui durante o envelhecimento em diversos grupos filogenéticos, inclusive em Caenorhabditis...
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Resumo
Resumo: A expressão global de microRNAs (miRNAs) diminui durante o envelhecimento em diversos grupos filogenéticos, inclusive em Caenorhabditis elegans. Entretanto, a identidade do mecanismo envolvido nessa alteração e qual o seu efeito sobre fenótipos associados ao envelhecimento ainda não foram determinados de forma conclusiva. Existem evidências de que certos miRNAs regulam o tempo de vida de C. elegans, e a proteína argonauta ALG-1 é uma importante reguladora da biogênese e da função de miRNAs em C. elegans. Posto isso, nessa dissertação descrevemos e interpretamos resultados obtidos em experimentos delineados para analisar o mecanismo de regulação transcricional de alg-1 e sua função na resposta a estressores oxidativos e térmicos, e na longevidade de C. elegans. Avaliamos, ainda, o perfil de expressão de miRNAs em animais sob condições ou de superexpressão de alg-1 (ALG-1 O/E), ou de longevidade do glp-1(e2144). Observamos que há pelo menos 5 repressores da transcrição de alg-1, os quais estão relacionados com o envelhecimento biológico. O knockdown de alg-1 retarda o desenvolvimento do C. elegans, diminui o tempo de vida, promove sensibilidade ao arsenito de sódio (NaAsO2), e inibe a longevidade do glp-1(e2144). ALG-1 O/E, por sua vez, não altera seu tempo de vida em condições fisiológicas ou em estresse térmico moderado, porém aumenta a resistência do C. elegans aos estressores oxidativos NaAsO2 e metil viologênio, este de modo dependente do miRNA cel-miR-71. Também foi possível demonstrar que há alteração global na expressão de miRNAs em glp-1(e2144). Dos 11 miRNAs diferencialmente expressos entre glp-1(e2144) e ALG-1 O/E, 8 também tem seus níveis de expressão alterados no modelo de longevidade induzida por restrição dietética, o eat-2(ad1116). Esses resultados constituem indícios de que ALG-1 pode participar na regulação do envelhecimento saudável ao atuar na defesa a estressores oxidativos em situações fisiopatológicas, e que a via da biogênese de miRNAs é um fator limitante para esses efeitos
Alterações na variabilidade genetica de Euterpe edulis Mart (Arecaceae)
Dias Filho, Claudemir Rodrigues
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP D543a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2006.
Assunto: Microssatélites (Genética)
Não informado
BCCL (1)
TESE - Inglês
Número de chamada: T/UNICAMP B275a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2014.
Assunto: Plantas - Mitocondria
Resumo: A proteína desacopladora mitocondrial 1 (UCP1) é uma proteína mitocondrial codificada pelo núcleo capaz de desacoplar o gradiente...
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Resumo
Resumo: A proteína desacopladora mitocondrial 1 (UCP1) é uma proteína mitocondrial codificada pelo núcleo capaz de desacoplar o gradiente eletroquímico usado para a síntese de ATP, dissipando a energia na forma de calor. A descoberta de homólogos e ortólogos da UCP1, sugere outros papéis fisiológicos para estas proteínas. As UCPs podem servir como uma válvula de escape, diminuindo a força protonmotiva (PMF) e reduzindo a produção de ROS em condições desfavoráveis. Plantas superexpressando UCPs se desenvolvem melhor quando submetidas a estresses bióticos e abióticos. Estas plantas demonstraram diminuição na produção de ROS, alteração no estado redox celular, além de um aumento no metabolismo energético e na fotossíntese. Neste trabalho nós investigamos os mecanismos moleculares envolvidos no metabolismo energético celular e resposta a estresses em plantas de tabaco superexpressando a UCP1 de A. thaliana. Demonstramos, através de análises moleculares e genômicas, que a superexpressão da UCP1 é capaz de provocar o aumento na respiração desacoplada em mitocôndrias isoladas, diminuir o conteúdo de ATP intracelular, e desencadear um processo de sinalização retrógrada que resulta na indução de genes mitocondriais e genes responsivos a estresses. Esta sinalização retrógrada resultou na indução do processo de biogênese mitocondrial verificado pelo aumento no número e área mitocondrial por célula, além de alterações morfológicas nestas organelas. O processo de biogênese mitocondrial nestas plantas é acompanhado pelo aumento na expressão de um grande número de genes responsivos a estresses, o que resulta no melhor desempenho e reduzida produção de ROS mitocondrial quando submetidas a estresses abióticos. A análise detalhada do transcriptoma de plantas superexpressando UCP1 em comparação com plantas selvagens demonstrou uma forte conexão entre os metabolismos mitocondrial, citoplasmático e cloroplástico para compensar as alterações provocadas pelo aumento na atividade da UCP1. Um grande número de fatores de transcrição ainda não caracterizados foram identificados e podem representar bons alvos para investigações futuras a respeito da regulação da biogênese mitocondrial e do metabolismo energético em plantas. Os resultados contidos nesta tese nos permitem melhor compreender a flexibilidade do metabolismo energético em plantas e identificar possíveis reguladores do processo de biogênese mitocondrial e resposta a estresses em plantas
BCCL (1)
TESE
Número de chamada: T/UNICAMP D569a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2015.
Assunto: Atrofia tímica
Resumo: A paracoccidioidomicose (PCM), uma doença crônica com disseminação fúngica causada pelo Paracoccidioides brasiliensis (Pb), afeta...
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Resumo
Resumo: A paracoccidioidomicose (PCM), uma doença crônica com disseminação fúngica causada pelo Paracoccidioides brasiliensis (Pb), afeta principalmente os trabalhadores rurais, entretanto casos de PCM em indivíduos imunossuprimidos aumentou consideravelmente. A resposta imunitária protetora contra o Pb é dependente da atividade de células T auxiliares, especialmente células Th1 produtoras de IFN-?. Tem sido proposto que Pb é capaz de modular a resposta imune para um estado permissivo e que o timo tem um papel importante. Neste trabalho, mostramos que a infecção aguda com Pb provoca alterações no ambiente do timo. Verificou-se que após sete dias de infecção, as células de levedura foram encontradas no estroma do timo e a expressão de citoqueratinas das células epiteliais tímicas foi alterada em relação à sua orientação espacial. O número absoluto de timócitos DPs e SPs foi reduzido após sete dias da infecção fúngica. Outras modificações foram em relação às moléculas de quimiocinas que direcionam a migração dos timócitos, sua expressão foi aumentada e como consequência, os timócitos, células T em diferenciação, apresentaram maior capacidade migratória ex vivo após sete dias da infecção. Não obstante, os camundongos infectados com Pb mostraram um aumento da frequência de células T que expressam TCR proibitivos nos baços, sugerindo que os processos de seleção que ocorrem no timo pode ser comprometidos na infecção aguda. Após 21 dias da infecção nos encontramos que houve retorno das alterações observadas para dados semelhantes aos obtidos nos camundongos controle. Os dados aqui apresentados poderão acrescentar novos mecanismos pelos quais Pb subverte a resposta imune para a infecção crónica observada em humanos
Pena, Izabella Agostinho, 1989-
TESE
Número de chamada: T/UNICAMP P37a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2015.
Assunto: Lisina - Catabolismo
Resumo: A via da sacaropina é considerada a principal rota para o catabolismo de lisina em mamíferos, na qual a enzima Aminoadipato Semialdeído...
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Resumo
Resumo: A via da sacaropina é considerada a principal rota para o catabolismo de lisina em mamíferos, na qual a enzima Aminoadipato Semialdeído Sintase (AASS) catalisa a oxidação da lisina ao aminoadipato semialdeído (AASA). Este é imediatamente oxidado a ácido aminoadípico (AAA) por ação da enzima Aminoadipato Semialdeído Desidrogenase (AASADH, codificada pelo gene aldh7a1). Em humanos, mutações no gene AASS são a causa da hiperlisinemia, um erro inato do metabolismo, porém benigno. Por outro lado, mutações no gene Aldh7a1 causam Epilepsia Dependente de Piridoxina (PDE), na qual o acúmulo de AASA e sua forma cíclica, Piperideine-6 Carboxilato (P6C), são consideradas as principais causas desta doença. Estes compostos causam depleção de Piridoxal-5¿ fosfato (PLP) do organismo por meio da formação de produtos de condensação com o composto P6C. Apesar de existir uma rota alternativa de degradação de lisina (conhecida como via do pipecolato), hipotetizamos que os níveis elevados de AASA/P6C observados no plasma e urina de pacientes com PDE decorrem, principalmente, da atividade da via da sacaropina, especificamente da enzima AASS. Durante o presente trabalho de doutorado, desenvolvemos um novo método quantitativo de espectrometria de massas (LC-MS/MS) que permitiu a analise dos metabólitos da degradação de lisina em plasma e tecidos de camundongos. Como resultado da quantificação de metabólitos e também experimentos de rastreio de 15N (usando-se injeção de lisina marcada no nitrogênio ? ou ?) sugerimos a enzima AASS como a principal enzima de degradação de lisina do organismo. Desta forma, esta enzima seria a responsável pela síntese da maior parte do AASA/P6C acumulado em pacientes de PDE e, sendo que esta enzima é principalmente hepática e renal, sugerimos estes órgãos como os principais sítios de produção destes compostos tóxicos. Adicionalmente, a ideia de que a via do pipecolato possui apenas um papel minoritário no metabolismo geral de lisina é também suportada por esses experimentos, onde cerca da metade deste composto circulante provavelmente se origina da via da sacaropina. Este efeito também foi observado e discutido por nós em outros modelos biológicos como bactéria (Ruegeria pomeroyi) e plantas (Zea mays). Sugerimos, portanto, que a escolha da AASS como alvo terapêutico para desenvolvimento de inibidores seja uma nova alternativa para tratamento de PDE, pois seria observada redução dos níveis tóxicos de AASA/P6C. Observamos que o uso de shRNA para realizar knockdown da expressão do gene aass em células HEK293T não resultou em nenhum fenótipo detrimental e também não causou indução dos genes da via do pipecolato. Ao estudarmos células primárias de cinco distintos pacientes de PDE (modelo de fibroblastos de pele) observamos que estas células possuem maior sensibilidade à presença de Lisina ao meio de cultura se comparadas à células normais. Como prova de conceito observamos que o knockdown da expressão de aass usando shRNA restaura a sobrevivência das células PDE na presença de altos níveis de lisina. Isso pode sugerir o uso de ASO (Anti-sense Oligonucleotides) ou inibidores da atividade da AASS para tratamento da PDE. Para promover melhor entendimento da bioquímica e biologia estrutural deste novo alvo terapêutico, expressamos, purificamos e obtivemos com sucesso a estrutura cristalográfica do domínio Sacaropina Desidrogenase (SDH) da enzima AASS humana. Propriedades cinéticas e bioquímicas da enzima foram estudadas, bem como foram realizados ensaios de screening de ligantes por desnaturação térmica e ensaios de atividade. Foram feitas várias rodadas de desenho computacional de inibidores baseados na estrutura do sítio ativo com o intuito de usar esta tecnologia para desenhar compostos que atuem competindo com a sacaropina pelo sítio ativo
Cruz, Pedro Rodrigues Sousa da, 1987-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP C889a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2012.
Assunto: Genética
Resumo: As doenças falciformes são...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
BCCL (1)
Lima Silva, Caio Cesar de, 1989-
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP L628a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2019.
Assunto: Ácido salicílico
Resumo: O ácido salicílico (SA) e seu éster de metila, salicilato de metila (MeSA), são conhecidos como indutores de defesa local e sistêmica em...
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Resumo
Resumo: O ácido salicílico (SA) e seu éster de metila, salicilato de metila (MeSA), são conhecidos como indutores de defesa local e sistêmica em plantas, respectivamente. SA é importante na resposta de defesa local contra microrganismos biotróficos, e sua conversão a partir de MeSA é essencial para o desenvolvimento da chamada resistência sistêmica adquirida (SAR). Essa conversão é realizada por metilesterases da família MES/SABP2. Em trabalho prévio, onde se analisou a expressão diferencial de genes de laranja doce (Citrus sinensis) em resposta a bactérias causadoras do Cancro Cítrico, identificou-se um gene que codifica uma proteína pertencente à família MES/SABP2, denominada CsMES1. CsMES1 é induzida localmente em resposta à infecção por Xanthomonas citri subsp. citri (Xc), agente causal do Cancro Cítrico em citros, mas preferencialmente induzida em resposta à infecção por Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii patotipo `C¿ (Xa), que induz uma resposta de hipersensibilidade em variedades de laranja doce. Assim, esse trabalho teve como principais objetivos avaliar o papel de CsMES1 na resposta de defesa local contra Xa e Xc, como também caracterizar bioquimicamente sua atividade enzimática. Neste?trabalho,?mostrou-se que CsMES1?não?é apenas?estruturalmente?homóloga?à proteína `Salicylic Acid-Binding Protein 2¿ de tabaco (NtSABP2), mas também catalisa a reação de conversão de MeSA em SA. Análises de modelos moleculares estruturais de CsMES1 indicam que CsMES1 e NtSABP2 apresentam a mesma tríade catalítica no sítio ativo e ligam SA de forma similar. Entretanto, verificou-se que CsMES1 possui uma menor afinidade por SA comparado à NtSABP2. Consistente com esses achados, identificou-se um polimorfismo de aminoácidos em um resíduo do sítio ativo nas proteínas da família MES de C. sinensis e outras espécies de plantas, que influencia de forma significativa a atividade metilesterásica sobre MeSA e a afinidade por SA. Através do uso de mutantes e modelagem molecular de CsMES1, verificou-se que a interação da cadeia lateral do resíduo polimórfico é dependente da hidroxila na posição orto do anel aromático de SA. Tais resultados explicam, assim, um possível papel do resíduo polimórfico na velocidade de reação como também no `feedback¿ negativo induzido pelo produto da reação. Esse trabalho mostra ainda que SA e transcritos de CsMES1 e outros genes envolvidos na via de sinalização de SA são detectados em folhas de laranja doce preferencialmente na interação incompatível com Xa, quando comparado à interação compatível com Xc. Além disso, verificou-se que aplicações de SA e MeSA em folhas de citros inibem o desenvolvimento dos sintomas do Cancro Cítrico, enquanto que um inibidor competitivo de CsMES1 aumenta a severidade desses sintomas. Os resultados, portanto, sugerem que CsMES1 e SA desempenham uma função importante na defesa local contra as bactérias causadoras do Cancro Cítrico
Ferreira, Natalia Cristina Verza
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP F413a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2006.
Assunto: Endosperma
Resumo: O seqüenciamento de ESTs (etiquetas de seqüências expressas) e a sua organização em bancos de dados constituem poderosas ferramentas para...
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Resumo
Resumo: O seqüenciamento de ESTs (etiquetas de seqüências expressas) e a sua organização em bancos de dados constituem poderosas ferramentas para identificar genes de interesse expressos em determinados tecidos e/ou tipos celulares. Neste trabalho criou-se um banco de seqüências expressas chamado MAIZESTdb, que contém ESTs de diversos tecidos de milho, porém enriquecido com seqüências provenientes do endosperma de milho em desenvolvimento. O MAIZESTdb contém 227.431 ESTs vindos de mais de 30 órgãos e tecidos de milho diferentes, 30.531 seqüenciados em nosso laboratório a partir de bibliotecas construídas com RNA mensageiro de endosperma. Estas seqüências representam uma grande contribuição na identificação de novos genes expressos no endosperma. A análise deste banco de ESTs possibilitou a identificação de 4.032 transcritos preferencialmente expressos no endosperma, e a sua anotação revelou uma ampla variedade de prováveis genes novos envolvidos no desenvolvimento e no metabolismo do endosperma. O banco MAIZESTdb foi utilizado neste trabalho para a identificação de fatores de transcrição (TFs) expressos no endosperma de milho, e, especialmente, na identificação de fatores preferencialmente expressos no endosperma, que podem desempenhar papéis regulatórios importantes durante a formação da semente. Foram identificados 1.233 TFs expressos em milho, 414 dos quais expressos no endosperma em desenvolvimento. Foram identificados ainda, através de análises in silico, 113 TFs preferencialmente expressos no endosperma, conjunto este que representa 9.2% dos TFs expressos identificados em milho, e que possivelmente contém reguladores importantes dos processos de especificação celular e desenvolvimento do endosperma de milho. Esta é a maior coleção de fatores de transcrição já descrita para este tecido, e representa uma fonte de dados importante para identificação de reguladores dos principais processos relacionados ao desenvolvimento do endosperma, como metabolismo de nitrogênio e carboidratos e controle da massa da semente. Uma das famílias mais representadas entre os TFs preferencialmente expressos no endosperma foi a família NAC de fatores de transcrição. Esta família apresentou 12 membros preferencialmente expressos no endosperma de milho. Um novo membro da família NAC, chamado de EPN-1 (Endosperm Specific NAM 1), teve seu perfil de expressão caracterizado. Sua expressão pode ser detectada desde os 5 DAPs, embora o pico de expressão ocorra entre 20 e 25 DAP, e ele apresenta expressão preferencial no endosperma. O promotor do gene EPN-1 foi clonado, seqüenciado e analisado quanto aos seus possíveis elementos CIS regulatórios; foram encontrados elementos conservados relacionados à endosperma-especificidade, elementos relacionados à regulação por ácido abscísico e giberelinas, e elementos conservados presentes nos promotores de a-amilases, indicando uma possível relação deste gene com o processo de transição entre a maturação e a germinação da semente. Ensaios de expressão transitória com o promotor do gene EPN-1 revelaram que sua expressão está dirigida à camada de aleurona do endosperma de milho, o que constitui mais uma evidência de sua possível função na regulação de genes relacionados aos processos de maturação e germinação da semente
BCCL (1)
Niederauer, Guilherme Francio, 1995-
DISSERTAÇÃO - Multilíngua
Número de chamada: T/UNICAMP N552a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2023.
Assunto: Redes reguladoras de genes
Resumo: No Brasil, o comércio e consumo de uvas e derivados apresentou grande aumento nas últimas décadas, levando a um crescimento na demanda, tanto...
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Resumo
Resumo: No Brasil, o comércio e consumo de uvas e derivados apresentou grande aumento nas últimas décadas, levando a um crescimento na demanda, tanto em termos de volume de produção, quanto na obtenção de variedades que apresentem expressivas características organolépticas e também adaptação aos diferentes climas do país. Devido à sua maior rusticidade, a videira ‘Niagara Rosada’ se destaca entre as variedades de uva de mesa cultivadas no Brasil, apresentando volumosa produção e tolerância aos fungos patogênicos mais recorrentes nas videiras. Apesar da sua importância para o setor vitivinícola brasileiro, até o momento, não há estudos na literatura voltados para investigação e descrição do seu perfil de expressão gênica e como esse perfil se diferencia entre os diferentes genótipos da cultivar. Atualmente, os programas de melhoramento genético vegetal estão integrando, aos métodos de melhoramento clássico, técnicas modernas de exploração e investigação ao nível molecular, como a genômica e a transcriptômica. Entre elas, a técnica de RNA-seq propicia a investigação de níveis de expressão gênica e como estes são alterados em função de diferentes variedades e condições experimentais, e, desta maneira, nos permite elucidar os mecanismos moleculares responsáveis pela determinação de características fenotípicas de interesse biológico e comercial. A modelagem de redes de coexpressão, por meio da correlação dos dados do RNA-seq, permite a identificação de genes com padrões associados de expressão e que atuam de forma coordenada e determinística no funcionamento de diferentes vias metabólicas, nesse contexto, o presente trabalho teve como objetivo investigar o perfil transcricional das bagas de três genótipos da videira Niagara (Branca, Rosada e Steck) em dois estágios fundamentais de desenvolvimento: veraison e maturação completa. Uma rede de coexpressão global foi modelada em paralelo com análises de enriquecimento funcional de grupos de genes diferencialmente expressos e/ou coexpressos. O genótipo N. Steck foi responsável pelos maiores valores de genes diferencialmente expressos, em ambos os estágios estudados, sobretudo, no veraison. A anotação funcional apontou enriquecimento de termos relacionados à regulação da transcrição, resposta hormonal, assim como vias metabólicas relacionadas à biossíntese de fenilpropanóides, estruturação de membrana plasmática e parede celular e produção de açúcares. A inferência das redes auxiliou na separação de grupos e funções afetadas pela expressão diferencial do genótipo N. Steck, mostrando uma grande relação desses transcritos com sinalização e resposta a diferentes fitohormônios e também com a produção de cera, cutícula e suberina, determinada, principalmente, por genes ortólogos aos genes CER1 e MYB41 respectivamente. Por fim, nossos resultados podem contribuir para o melhor entendimento dos mecanismos genéticos envolvidos na determinação das diferenças fenotípicas dos genótipos estudados, assim como o envolvimento de genes pouco conhecidos na determinação do desenvolvimento e amadurecimento das bagas de uvas e de suas características organolépticas, trazendo novos potenciais alvos para o melhoramento genético de videiras e obtenção de novas variedades melhores adaptadas ao clima brasileiro e também mais competitivas no mercado
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP V833a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2019.
Assunto: Análise de mutantes
Resumo: "Escherichia coli" é um bastonete Gram negativo, não esporulado, oxidase negativo, móvel por flagelos peritríquios, ou imóvel. Esta bactéria...
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Resumo
Resumo: "Escherichia coli" é um bastonete Gram negativo, não esporulado, oxidase negativo, móvel por flagelos peritríquios, ou imóvel. Esta bactéria está presente no trato gastrintestinal de seres humanos e de outros animais, constituindo parte da microbiota normal. Existem, porém, linhagens que também são patogênicas. Entre as linhagens patogênicas, aquelas denominadas Escherichia coli patogênica para aves (APEC) são responsáveis por vários processos patológicos. De maneira geral, as infecções causadas por APEC são coletivamente denominadas Colibacilose e representam grave ameaça econômica à produção de aves em todos os países por produzirem níveis significativos de mortalidade e morbidade. Embora vários genes e mecanismos genéticos já tenham sido descritos como sendo responsáveis pela patogenicidade e mecanismos de virulência das linhagens APEC, muitos outros ainda podem existir devido à heterogeneidade genética desta população bacteriana. Alguns trabalhos demonstraram que o operon Lisina Descarboxilase (CAD) influencia características de linhagens de Shigella, linhagens diarreiogênicas de E. coli de origem humana e Salmonella, entre outras, mediando um efeito "patoadaptativo" sobre a patogenicidade e outras características biológicas das diferentes linhagens estudadas. Em linhagens APEC, não existem estudos envolvendo o operon CAD (genes cadA, cadB, cadC), frente a isso, decidimos estudar genes possivelmente envolvidos com a patogenicidade de uma linhagem APEC causadora de Síndrome da Cabeça Inchada (SCI-07) e verificar seu efeito através de suas característica biológicas ou de virulência, em comparação com a linhagem selvagem original e sua linhagem complementada. Os resultados aqui obtidos nos permitiram ver que o gene cadC possuí uma grande influencia na patogenicidade em aves SCI 07 ¿ APEC, reduzindo, significamente, a mortalidade em aves de um dia de idade