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Resumo: Nesta dissertação foram realizados estudos cariotípicos, morfométricos e testes de cruzamentos em diferentes linhagens de Cochliomyla hominivorax. Esta espécie é considerada uma das principais causadoras de miíases no Brasil, que atacando especialmente animais domésticos ocasiona grandes prejuízos econômicos à pecuária.Verificou-se que ao lado da uniformidade no número de cromossomos (2n = 12 cromossomos), encontra-se uma grande variação cariotípica, colocando C. hominivorax entre as espécies de insetos que apresentam grande variabilidade cartotípica em populações naturais. As variações, ocorrem tanto nos autossomos quanto nos cromossomos sexuais sendo que nestes últimos as variações encontradas foram maiores e mais evidentes que a dos autossomos.Pela análise morfológica dos cromossomos, corados com Glemsa, de nove linhagens de C. hominivorax, foi possível identificar seis cariótipos diferentes. As principais diferenças cariotípicas interlinhagens se referem ao comprimento dos cromossomos, localização e número de constrições secundárias além da posição do centrômero. Através desta análise cromossômica foi possível identificar em condições naturais, ou seja, em Caraguatatuba, além do cariótipo comumente encontrado, um híbrido cromossômico onde as fêmeas da amostra possuiam dois tipos morfologicamente distintos de cromossomos X, sendo um equivalente ao da linhagem local Ca-l (SP), e outro se assemelha a da linhagem Poconé (KT> linhagem MT-2. Além do emprego de Giemsa para a coloração dos cromossomos, foi utilizado método de banda Q, cujos resultados demonstraram também variabilidade. Através da utilização de quinacrina mostarda, foram evidenciadas diferenças interlinhagens na intensidade e volume das regiões fluorescentes, tanto nos autossomos como nos cromossomos sexuais. Esta técnica mostrou ser um excelente marcador para diagnosticar o cromossomo 3 de todas as linhagens.Nos híbridos analisados o padrão de banda Q de cada par de cromossomos mantém as características da linhagem parental as quais foram provenientes, possibilitando a identificação de cada par cromossômico como também inferir sobre a proveniência dos híbridos. Os resultados dos testes de cruzamentos realizados, indicaram que todas as linhagens mostraram-se interférteis com relação a uma linhagem considerada padrão (linhagem Ca-l). Porém, em alguns cruzamentos, houve dificuldade na obtenção de fecundação nos testes de laboratório. Nos retrocruzamentos realizados a razão sexual normal de 1:1 foi alterada sendo o número de fêmeas maior que o de machos, além da produção de indivíduos anormais.A análise morfométrica, também indicou variabilidade entre as linhagens analisadas. Dos dezenove caracteres da morfologia externa de adultos e das 26 relações estabelecidas entre estes caracteres, utilizando análise de variância univariada e multivariada foram identificadas diferenças capazes de identificar as linhagens. As linhagens de C. hominivorax podem ser caracterizadas pela análise cariotípica e morfométrica, indicando que é possível estabelecer uma correlação entre estas duas metodologias para identificar diferentes amostras e linhagens desta espécie.Temos boas evidências baseadas nos dados cariotípicos existentes na literatura associado aos dados obtidos neste trabalho, incluindo a análise morfométrica, que C. hominivorax é o complexo biológico em franco processo evolutivo. As análises realizadas neste trabalho forneceram significativos dados complementares aos já existentes, sobre a biologia o C. hominivorax e além disso, abriram novas áreas de estudo desta importante praga da pecuária