121 registros encontrados - programa Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular E área de concentração Microbiologia
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP So85p
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2020.
Assunto: Pseudomonas
Resumo: "Pseudomonas" é um grupo bacteriano com capacidade de colonizar uma grande gama de ambientes. As do grupo fluorescente são conhecidas...
Ver mais
Resumo
Resumo: "Pseudomonas" é um grupo bacteriano com capacidade de colonizar uma grande gama de ambientes. As do grupo fluorescente são conhecidas principalmente por serem benéficas aos vegetais, conferindo um ganho na produção e dando maior proteção contra possíveis patógenos. Durante as anotações do banco de ESTs de Coffee arabica detectou-se uma grande quantidade de sequências de "Pseudomonas" no banco. Através de isolamentos feitos nas folhas, rizosfera e das raízes de Coffea arabica constatou-se a presença destas bactérias e, posteriormente, foram selecionados três isolados distintos de cada ambiente mencionado; seus genomas foram sequenciados e em paralelo foram executados experimentos para verificar diferenças fisiológicas entre os isolados. Os genes identificados a partir do isolado de folha sugerem que ele está adaptado às tensões abióticas do ambiente da superfície foliar, o que confirmamos por experimentos de estresse osmótico e privação de ferro. O isolado a partir da região interna das raízes possui receptores sideróforos de acromobactina e aerobactina, mas não possui os genes responsáveis pela produção desses sideróforos, sugerindo uma interessante estratégia de competição baseada no furto de sideróforos de outras espécies. Todas as três bactérias foram capazes de aumentar o crescimento de plântulas de alface, principalmente o isolado de rizosfera. Curiosamente, o isolado de folha foi capaz de colonizar as folhas das plantas após a bacterização das sementes, sugerindo uma inespecificidade quanto ao hospedeiro. Além disso, os três isolados foram capazes de degradar compostos fenólicos, e em alguns casos utilizando-os como fonte metabólica. Entretanto, elas não foram capazes de utilizarem cafeína como fontes de nitrogênio e carbono. Em termos de análise de controle biológico, o isolado de folha foi capaz de diminuir o dano provocado pela ferrugem-do-café, podendo ser uma alternativa para o controle dessa praga. A partir dos nossos dados, discutimos a relação entre o conteúdo gênico e os dados experimentais indicando que existem adaptações dessas bactérias para viverem em associação com o cafeeiro em diferentes nichos
Toledo-Teixeira, Daniel Augusto de, 1993-
TESE - Multilíngua
Número de chamada: T/UNICAMP T575r
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2023.
Assunto: Oropouche orthobunyavirus
Resumo: Patógenos têm emergido e re-emergido em diversos países causando imenso impacto na saúde pública, especialmente nos últimos anos. A recente...
Ver mais
Resumo
Resumo: Patógenos têm emergido e re-emergido em diversos países causando imenso impacto na saúde pública, especialmente nos últimos anos. A recente pandemia do Coronavírus SARS-CoV-2 causando a COVID-19 nos mostrou a necessidade de estarmos preparados para a emergência de novos patógenos na população. No Brasil, grandes surtos de Orthobunyavirus oropoucheense (OROV) na região Amazônica já foram documentados, demonstrando o impacto que os arbovírus – os vírus transmitidos por artrópodes – podem nos trazer. A doença causada por OROV, conhecida como febre do Oropouche, é bastante semelhante à dengue com caráter febril exantemático. Entretanto, uma parcela dos infectados pode evoluir para quadros graves da doença como meningite, encefalite e outras doenças neurológicas. Os detalhes da patogênese e as respostas inata e adaptativa na proteção da primo-infecção por OROV e o desenvolvimento de doença neurológica ainda não estão totalmente entendidos. Assim, o objetivo dessa tese foi investigar o papel de células B na imunidade inata e adaptativa durante da neuroinvasão e patogênese causada por OROV no primeiro contato com o agente viral. Observamos que camundongos Rag1–/– com deficiência de linfócitos B e T maduros foram 100% suscetíveis à infecção, acompanhados de elevados títulos virais disseminados por órgãos periféricos ou do sistema nervoso central (SNC). Paralelamente, camundongos deficientes apenas de células B maduras (?MT), também foram suscetíveis e tiveram massiva replicação viral disseminada com sinais de dano neurológico. Por outro lado, camundongos selvagens (WT) ou camundongos deficientes apenas de células T maduras (TCRbd) foram resistentes. Animais WT eficientemente e rapidamente produzem altos títulos de anticorpos neutralizantes detectados no soro com elevada potência, sendo essencial para o controle da doença durante a transferência passiva para Rag1–/–. A resposta de interferon do tipo I em células B, ou CD19+, não se fez essencial no controle da doença, mas a resposta de MyD88 nessas células foi crucial para a proteção contra o estabelecimento da doença neurológica. Cerca de 30% dos animais CD19-Cre+ MyD88fl foram suscetíveis à infecção por OROV, tiveram altos títulos virais e sinais de dano neurológico, acompanhado de menor resposta de anticorpos neutralizantes e expansão de diversas células B, especialmente da zona marginal do baço. Análises computacionais confirmaram que células B da zona marginal são centrais na diferenciação dos grupos de animais selvagens e com deficiência de MyD88, células estas responsáveis por respostas a antígenos não proteicos de forma independente de células T. Desse modo, nossos resultados demonstraram que células B são componentes-chave na proteção contra a doença causada por OROV em modelo murino durante a primo-infecção através da rápida montagem de uma resposta adaptativa efetiva controlando a disseminação viral para o SNC
Ação reguladora de genes estimulados por Interferon (ISGs) na infecção pelo vírus Oropouche (OROV)
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP M616a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2019.
Assunto: Fatores reguladores de interferon
Resumo: O sistema de interferon (IFN) é filogeneticamente antigo e desempenha papel essencial na resposta contra vírus, uma vez que ele é capaz de...
Ver mais
Resumo
Resumo: O sistema de interferon (IFN) é filogeneticamente antigo e desempenha papel essencial na resposta contra vírus, uma vez que ele é capaz de controlar a maioria das infecções virais, mesmo na ausência da imunidade adaptativa. Os fatores celulares que medeiam essa defesa são produtos de genes estimulados por Interferon (ISGs). Embora centenas de ISGs tenham sido identificados desde sua descoberta há mais de 25 anos, ainda não sabemos quais genes são essenciais para o controle de arbovírus emergentes brasileiros, como o vírus Oropouche (OROV). OROV é prevalente em toda região Amazônica, associado com quadros clínicos debilitantes, que podem variar desde quadros febris-exantemáticos até quadros graves, com acometimento neurológico. Assim, a compreensão das complexas interações entre OROV e seus hospedeiros serão cruciais para determinação dos fatores patogenéticos associados com o desenvolvimento de doenças graves, assim como para o desenvolvimento de estratégias de controle. Desse modo, analisamos o papel de 12 ISGs (IFIT1, IFITM1, IFIT2, IFITM2, IFIT3, IFITM3, IFIT5, ADAR, IRF1, LY6E, ISG20 e BST2) no controle da infecção por OROV a nível celular. Para isso, Citometria de Fluxo (FACS) foi aplicada para quantificar a taxa de infecção por OROV em células geneticamente modificadas que superexpressavam esses 12 ISGs. Para tanto, células de linhagem humana (HT1080) foram transduzidas com uma minibiblioteca de vetores lentivirais expressando ISGs e infectadas com OROV. Os dados demonstraram que alguns ISGs podem ser essenciais no controle do OROV, visto que a superexpressão desses genes diminuiu significantemente a taxa de infecção por esse vírus. Particularmente, LY6E apresentou resultados mais promissores, pois a inibição da infecção por OROV foi acompanhada do aumento significativo da expressão desse gene após transdução com o vetor lentiviral. Desta forma, esse estudo fornece a primeira evidência do papel de LY6E na restrição da replicação de OROV. Estudos mais aprofundados são necessários para entender o papel do produto desse gene e do polimorfismo inerente a ele no controle ou desenvolvimento de doença por esse importante arbovírus emergente brasileiro
TESE - r d
Número de chamada: T/UNICAMP AL64a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2004.
Assunto: Imuno-histoquímica - Diagnóstico
Resumo: O Vírus Respiratório Sincicial Bovino (BRSV) é o agente etiológico de infecções respiratórias amplamente distribuídas e que produzem perdas...
Ver mais
Resumo
Resumo: O Vírus Respiratório Sincicial Bovino (BRSV) é o agente etiológico de infecções respiratórias amplamente distribuídas e que produzem perdas importantes na criação comercial de bovinos. A infecção pelo BRSV produz alterações patológicas como bronquiolite e pneumonia intersticial e acomete, sobretudo, animais jovens. A limitada multiplicação do vírus em cultivos celulares e a sua instabilidade, representam dificuldades durante os procedimentos de isolamento do BRSV a partir de amostras clínicas. O presente trabalho teve como objetivo padronizar técnicas rápidas, sensíveis e específicas para a detecção do BRSV, utilizando um isolado brasileiro. Para tanto, foram utilizados camundongos Balb/c como modelo de infecção experimental pelo BRSV, a partir dos quais o vírus foi detectado pelas técnicas de RT-nested-PCR e imuno-histoquímica (IHQ) e os resultados foram comparados com aqueles obtidos em bovinos infectados experimentalmente. A técnica de RT-nested-PCR mostrou-se mais sensível para detecção do BRSV do que a técnica de IHQ, tanto para tecidos murinos quanto bovinos. As técnicas foram utilizadas em tecidos de bovinos suspeitos de infecção por BRSV. Uma destas amostras apresentou resultado positivo no RT-nested-PCR e na IHQ. O seqüenciamento dos produtos de PCR deste vírus detectado foi realizado. Esta nova estirpe, juntamente com a descrita previamente BRSV-25-BR (único isolado presente até então no Brasil), é representante do subgrupo B do BRSV e constitui importante ferramenta para a avaliação do perfil dos isolados brasileiros de BRSV, estimar a origem destes isolados e redefinir as necessidades locais com relação ao conteúdo das vacinas. As técnicas de RTnested- PCR e IHQ padronizadas serão úteis em estudos epidemiológicos bem como, no diagnóstico laboratorial do BRSV no Brasil
BCCL (1)
DISSERTAÇÃO - r d
Número de chamada: T/UNICAMP M366a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2006.
Assunto: Adenovirus
Resumo: O tratamento de esgoto sanitário em lagoa de decantação anaeróbia e disposição controlada de água residuária no solo é uma alternativa de...
Ver mais
Resumo
Resumo: O tratamento de esgoto sanitário em lagoa de decantação anaeróbia e disposição controlada de água residuária no solo é uma alternativa de baixo custo para o reuso de águas residuárias na agricultura. Nele, o esgoto sanitário é depositado em uma lagoa de decantação anaeróbia com retenção hidráulica de sete dias, após o que a água residuária é conduzida para rampa de solo franco argilo-arenoso, com cobertura vegetal de gramínia Cynodon sp, para disposição por escoamento superficial, seguindo-se sua infiltração e percolação. O objetivo desse trabalho foi verificar a eficiência desse sistema na eliminação e/ou inativação de adenovírus humanos (HAdV) e rotavírus (RV). Amostras de 1L de água residuária foram obtidas em quatro coletas, em intervalos de sete dias, na entrada do esgoto bruto (EB), no ponto de aplicação na rampa (0m) e nos pontos da sua superfície após 10, 20, 30, 35m e 40m. Sob a rampa, a 1m de profundidade e distantes 30m (30-1) e 35m (35 -1), dois pontos foram amostrados. Antes do ponto 0m, pontos de testemunha a 1m de profundidade e distantes 2m (T1) e 0,5m (T2) da rampa, e um ponto do lençol freático (LF) a 3m de profundidade, também foram coletados.As água residuárias foram concentradas de 1.000 a 5.000 vezes por filtração e eluição em membrana eletropositiva e ultracentrifugação. Nos eluatos obtidos, após extração de DNA, a presença de HAdV foi pesquisada por PCR e nested-PCR. Para a detecção de RV usou-se RT-PCR e duplo-semi- nested-PCR. Eluatos HAdV positivos foram inoculados em células HEp-2 e após até cinco passagens a presença de HAdV foi confirmada por PCR.. HAdV foram detectados em 29 das 35 amostras analisadas, sendo positivos todos os pontos de EB e da superfície da rampa. Em profundidade, sob a rampa, quatro amostras foram positivas, além de outras duas em T2 e uma em LF, o que demonstra a percolação desses vírus no solo com contaminação do LF. Quando testadas em células HEp-2, nas amostras do EB e dos pontos 0, 30, 35 e 40m a presença de vírions foi determinada, enquanto nos pontos 30-1m e LF os HAdV não foram infectivos. Esses resultados permitem concluir que o sistema não foi eficiente para remover e/ou inativar HAdV. Por outro lado, pode-se afirmar que os HAdV são indicadores virais adequados para esse sistema, desde que mantida a metodologia aqui empregada. Uma amostra de EB foi positiva para RV (genotipos G1 e G2), resultado esse que não permite qualquer conclusão. Para o reuso da água residuária advinda desse sistema impõe-se a associação de processos de desinfecção para a eliminação de HAdV
BCCL (1)
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP V833a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2019.
Assunto: Análise de mutantes
Resumo: "Escherichia coli" é um bastonete Gram negativo, não esporulado, oxidase negativo, móvel por flagelos peritríquios, ou imóvel. Esta bactéria...
Ver mais
Resumo
Resumo: "Escherichia coli" é um bastonete Gram negativo, não esporulado, oxidase negativo, móvel por flagelos peritríquios, ou imóvel. Esta bactéria está presente no trato gastrintestinal de seres humanos e de outros animais, constituindo parte da microbiota normal. Existem, porém, linhagens que também são patogênicas. Entre as linhagens patogênicas, aquelas denominadas Escherichia coli patogênica para aves (APEC) são responsáveis por vários processos patológicos. De maneira geral, as infecções causadas por APEC são coletivamente denominadas Colibacilose e representam grave ameaça econômica à produção de aves em todos os países por produzirem níveis significativos de mortalidade e morbidade. Embora vários genes e mecanismos genéticos já tenham sido descritos como sendo responsáveis pela patogenicidade e mecanismos de virulência das linhagens APEC, muitos outros ainda podem existir devido à heterogeneidade genética desta população bacteriana. Alguns trabalhos demonstraram que o operon Lisina Descarboxilase (CAD) influencia características de linhagens de Shigella, linhagens diarreiogênicas de E. coli de origem humana e Salmonella, entre outras, mediando um efeito "patoadaptativo" sobre a patogenicidade e outras características biológicas das diferentes linhagens estudadas. Em linhagens APEC, não existem estudos envolvendo o operon CAD (genes cadA, cadB, cadC), frente a isso, decidimos estudar genes possivelmente envolvidos com a patogenicidade de uma linhagem APEC causadora de Síndrome da Cabeça Inchada (SCI-07) e verificar seu efeito através de suas característica biológicas ou de virulência, em comparação com a linhagem selvagem original e sua linhagem complementada. Os resultados aqui obtidos nos permitiram ver que o gene cadC possuí uma grande influencia na patogenicidade em aves SCI 07 ¿ APEC, reduzindo, significamente, a mortalidade em aves de um dia de idade
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP B644a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2019.
Assunto: Trichoderma reesei
Resumo: Os biocombustíveis, em particular o etanol de segunda geração (2G), são hoje uma das principais alternativas sustentáveis à substituição dos...
Ver mais
Resumo
Resumo: Os biocombustíveis, em particular o etanol de segunda geração (2G), são hoje uma das principais alternativas sustentáveis à substituição dos combustíveis fósseis em direção à consolidação de uma bioeconomia circular. No Brasil, o etanol 2G é produzido a partir do bagaço e palha da cana-de-açúcar, que são resíduos lignocelulósicos gerados em abundância na cadeia produtiva do setor sucroenergético. Esta tecnologia, entretanto, apresenta ainda algumas limitações econômicas, como o custo elevado dos coquetéis enzimáticos necessários à hidrólise da biomassa lignocelulósica. O fungo filamentoso Trichoderma reesei é considerado a principal plataforma biológica da produção e secreção de celulases e hemicelulases que compõem os coquetéis enzimáticos. Embora o sistema celulolítico e regulação transcricional de T. reesei sejam muito estudados, ainda é necessário investigar o conjunto total de genes relacionados com a degradação de biomassa lignocelulósica por este fungo. Assim, os objetivos principais deste estudo foram a inferência de uma rede de co-expressão gênica baseada no transcriptoma de T. reesei RUT-C30 e a caracterização de alguns genes identificados com potencial biotecnológico em cepas mutantes knockout. A inferência da rede separou os genes hiper-expressos em bagaço (BEX) em diversos módulos, de acordo com o perfil de expressão gênica. Vários genes de (hemi)celulases, transportadores de açúcar, fatores de transcrição e proteínas hipotéticas foram co-expressos nos mesmos módulos. Genes centrais destes módulos (hubs) foram identificados, e incluíram fatores de transcrição e proteínas hipotéticas ainda não caracterizados. A predição in silico de sítios de ligação ao DNA na região promotora para XYR1, o principal ativador de celulases, revelou ainda genes interessantes que podem ser regulados por este fator de transcrição. A partir da análise de rede, seis genes foram escolhidos para serem deletados e caracterizados em T. reesei. Quatro deles foram deletados com sucesso e um gene codificando para um fator de transcrição hipotético do tipo zinc finger mostrou ter papel positivo sobre a degradação de bagaço, uma vez que sua deleção diminuiu significativamente as atividades de celobiohidrolase (pNPC) e beta-glicosidase (pNPG) nesta fonte de carbono. Dados de expressão gênica por qPCR demonstraram também que este gene é alvo da repressão catabólica por carbono mediada pelo regulador CRE1. Adicionalmente, o perfil metabólico de T. reesei e Aspergillus niger crescidos em glicose, celulose solúvel (CMC), lactose e bagaço pré-tratado foi investigado por RMN para avaliar as vias metabólicas utilizadas por estes dois fungos industriais. A fonte de carbono utilizada foi a maior responsável pela variação dos dados, sugerindo que ambos os fungos adotam estratégias semelhantes para crescerem e se adaptarem aos substratos avaliados, mesmo tendo evoluído independemente. Metabólitos de reserva de energia (manitol e trealose), de metabolismo de fosfolipídeos (glicerol-3-fosfocolina) e de aminoácidos (glutamina, alanina e glutamato) foram significativamente mais abundantes em todas as condições amostradas para ambos os fungos. T. reesei assimilou de forma mais eficiente o açúcar lactose, e também parece ativar a via alternativa do TCA (glyoxalate shunt) em CMC como estratégia para produzir energia pela gliconeogênese. A. niger, por outro lado, mostrou níveis mais altos de glicerol e GABA em CMC e lactose. Em BEX, A. niger teve as maiores atividades enzimáticas para celulase e hemicelulase, contribuindo para maior ativação da via glicolítica. Como conclusões deste trabalho, a análise da rede de co-expressão gênica permitiu a identificação de um grande número de genes com potencial biotecnológico na degradação de bagaço de cana. A caracterização dos mutantes knockout levou à descoberta de um suposto ativador transcricional de celulases, mas estudos adicionais devem ser realizados para compreender melhor sua atuação sobre a regulação gênica em T. reesei. O perfil metabólico de T. reesei e A. niger revelou ainda que ambos os fungos utilizam estratégias parecidas com poucas diferenças na utilização de diferentes fontes de carbono, e contribuiu para a maior compreensão da fisiologia dos fungos em condições que induzem a produção de enzimas hidrolíticas. Por fim, os resultados obtidos neste trabalho contribuíram para o maior entendimento do sistema celulolítico em T. reesei e podem ajudar a reduzir os custos associados ao etanol 2G
Santana, Eliane Silva de, 1990-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP Sa59a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2021.
Assunto: Xanthomonas citri subsp. citri
Resumo: As bactérias são capazes de perceber o meio biótico e abiótico e se adaptar alterando a expressão gênica. Os fatores de transcrição são...
Ver mais
Resumo
Resumo: As bactérias são capazes de perceber o meio biótico e abiótico e se adaptar alterando a expressão gênica. Os fatores de transcrição são proteínas capazes de se ligar a regiões promotoras no DNA aumentando ou diminuindo a eficiência de recrutamento da RNA polimerase e a transcrição dos genes. A bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (X. citri) é fitopatogênica de diversas espécies de citros de importância econômica. Quando em contato com o mesófilo causa o cancro cítrico, doença caracterizada pela presença de lesões em folhas e frutos, reduzindo a qualidade de frutos e a produtividade agrícola. O objetivo deste trabalho foi analisar o papel do fator de transcrição da família AraC/ XylS denominado TagK na expressão dos genes do sistema de secreção do tipo VI (SSVI), maquinaria que atua na translocação de toxinas e proteínas efetoras envolvidas na patogenicidade e competição com organismos procariontes e eucariontes. As análises de filogenia indicaram que TagK, assim como outros reguladores já descritos na literatura, como SoxS, MarA e Rob de E. coli, não possui o domínio de ligação a indutor e o domínio de ligação ao DNA no mesmo polipeptídio e, portanto, precisa de outros reguladores que aumentem ou diminuam sua própria transcrição. Foi possível observar também que as linhagens que possuem o SSVI pertencente ao mesmo clado de X. citri tem tagK associado ao cluster do SSVI, o que não ocorre com os demais clados. Além disso, a análise de homologia com outros reguladores da família já caracterizados experimentalmente, indicou a presença de resíduos conservados que são importantes para a ligação da proteína ao promotor (S40 e R96) e para manutenção da estrutura terciária (L44, F48, L72, F98, P106). Resultados experimentais indicaram que a superexpressão de tagK em X. citri promoveu aumento dos níveis de RNA mensageiro de genes essenciais para o funcionamento do SSVI e que foi responsável por regular todos os genes presentes no contexto genômico do SSVI, além do SSV inserido no SSVI de X. citri. Dados anteriores do nosso grupo de pesquisa demostraram que o fator sigma ecfK de X. citri é essencial para a resistência à predação pela ameba de solo Dictyostelium discoideum e para a indução da expressão do SSVI nestas condições. Os resultados obtidos no presente trabalho suportam a hipótese de que TagK atue diretamente na indução da transcrição dos genes do SSVI e, portanto, abaixo de EcfK na via de regulação, já que a superexpressão de tagK foi suficiente para restaurar o fenótipo selvagem às linhagens que possuem a deleção do fator sigma ecfK. Portanto, de acordo com o modelo proposto, quando X. citri recebe o sinal para que o SSVI seja ativado, EcfK se liga a RNA polimerase e ativa a transcrição de tagK, que é o responsável por ativar os genes do SSVI, levando ao acúmulo das proteínas
Análise dos mecanismos da atividade antimicrobiana da violaceína sobre Staphylococcus aureus
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP L628a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2013.
Assunto: Anti-infecciosos
Resumo: A violaceína é um pigmento violeta produzido por algumas espécies bacterianas de origem ambiental, tais como Chromobacterium violaceum e...
Ver mais
Resumo
Resumo: A violaceína é um pigmento violeta produzido por algumas espécies bacterianas de origem ambiental, tais como Chromobacterium violaceum e Janthinobacterium lividum. Esta molécula apresenta várias propriedades biológicas incluindo antibacteriana, antifúngica, antiviral, antiprotozoária e antitumoral, apesar de sua função exata na fisiologia dos micro-organismos que a produz, ainda é desconhecido. No presente trabalho, a atividade antimicrobiana da violaceína produzida comercialmente, o extrato semi purificado e nanopartículas de vanadato de prata foram avaliados contra espécies de bacterianas gram-positivas e gram-negativas. A violaceína exibiu efeito antimicrobiano contra Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) e Enterococcus resistente à vancomicina (VRE), que são micro-organismos frequentemente relacionados com infecções adquiridas em hospitais. Os valores de MIC (concentração inibitória mínima) e MBC (concentração bactericida mínima) da violaceína produzida comercialmente foram de 0,625 ?M e 1,25 ?M respectivamente e, análise de curvas de crescimento e tempo-morte revelaram um efeito antibacteriano durante 12 horas contra MRSA. A microscopia eletrônica de transmissão mostrou os efeitos da violaceína com alterações morfológicas e ultra estruturais, incluindo alterações na parede celular e formação de septos de divisão anormais. Nos resultados obtidos das análises de proteômica e transcriptoma a violaceína afetou a expressão de várias classes funcionais de proteínas e genes em MRSA, incluindo processos biológicos em biossíntese da parede celular e divisão celular que corroboram as alterações ultra estruturais visualizadas. Em conclusão, a violaceína produzida comercialmente demonstrou atividade antimicrobiana para S. aureus MRSA e pela primeira vez, os efeitos da violaceína sobre o metabolismo de S. aureus foram descritos, indicando possíveis alvos e vias metabólicas afetadas por esta droga. No seu conjunto, estes dados indicam a violaceína como uma droga potencial para o tratamento de infecções provocadas por MRSA
BCCL (1)
Spilki, Fernando Rosado, 1975-
TESE - r d
Número de chamada: T/UNICAMP Sp45a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2007.
Assunto: Análise filogenética
Resumo: O Vírus Respiratório Sincicial Bovino (BRSV) é uma causa importante de doença respiratória em bovinos. O BRSV é um membro da família...
Ver mais
Resumo
Resumo: O Vírus Respiratório Sincicial Bovino (BRSV) é uma causa importante de doença respiratória em bovinos. O BRSV é um membro da família Paramyxoviridae, subfamília Pneumovirinae, pertencendo ao gênero Pneumovirus. Nos últimos quinze anos, evidências sorológicas e de isolamento do vírus revelaram que o BRSV está circulando no Brasil, causando doença clinicamente evidente ou formas subclínicas da infecção. Na primeira parte do presente trabalho, seis diferentes linhagens celulares foram examinadas quanto a sua susceptibilidade à infecção pelo BRSV, levando em conta a variabilidade entre diferentes isolados e características de crescimento do vírus. Chicken embryo related cells (CER), e células CRIB (MDBK-resistentes à infecção pelo Vírus da Diarréia Viral Bovina, BVDV) foram as mais apropriadas à multiplicação do vírus. Ambas as linhagens permitiram o cultivo do vírus em títulos de até 105,5 DICC50 (Doses Infectantes para 50% dos Cultivos Celulares por 100 IlL)...Observação: O resumo, na íntegra poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
BCCL (1)
Fernandes, Maria Judite Bittencourt
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP F391a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2010.
Assunto: Vírus da doença infecciosa da bursa
Resumo: A doença infecciosa da bursa (IBD), denominada também doença de Gumboro, é uma doença aguda, imunossupressora, altamente contagiosa de aves...
Ver mais
Resumo
Resumo: A doença infecciosa da bursa (IBD), denominada também doença de Gumboro, é uma doença aguda, imunossupressora, altamente contagiosa de aves jovens e de grande importância econômica para a avicultura. O vírus da doença infecciosa da bursa (IBDV), sorotipo 1, pode ser classificado de acordo com sua antigenicidade e patogenicidade em amostras clássicas virulentas (cv), atenuadas, variantes antigênicas ou muito virulentas (vv). Estas diferenças antigênicas são encontradas na região hipervariável do gene VP2, que é responsável pela indução de anticorpos neutralizantes e também dos possíveis marcadores de virulência que ainda não estão bem estabelecidos. O gene VP1 parece também apresentar um papel na virulência do vírus. Primeiramente, o objetivo do presente trabalho foi a identificação e caracterização molecular de 66 amostras brasileiras de IBDV através da RT-PCR de um fragmento do gene VP2 seguida pela digestão por enzimas de restrição (RE) e posterior confirmação pelo sequenciamento. A análise da RT-PCR/RE classificou 25 isolados como cepas vv e 16 como cepas cv além da classificação de 6 grupo moleculares. O sequenciamento também confirmou esta classificação com a presnça dos aminoácidos (aa) típicos das amostras vv (222A, 242I, 256I e 294I). Em 3 destes amostras vv também se observou mutações únicas que mostram pequenas, mas contínuas alterações dos vvIBDV circulantes nas granjas brasileiras. A arvore filogenética confirmou a origem comum das nossas amostras vv com os isolados de outros países assim como a origem monofilética destas amostras. Posteriormente foi feito a RT-PCR de um fragmento representativo do gene VP1 das amostras positivas para IBDV e a análise das sequências e filogenética. Quatorze amostras vv e três cv tiveram êxito nas sequências analisadas. Treze amostras vv apresentaram as substituições de aa comuns para as amostras vv (145T, 146D, 147N e 242E), exceto um que apresentou a sequência das amostras cv e na filogenia agrupou-se com estas amostras. A árvore a partir da VP1 pressupõe um rearranjo genético deste gene. Esta amostra com perfil do segmento A de amostra vv e do segmento B de cv seria o primeiro relato no Brasil de um rearranjo genético natural. Estes rearranjos de segmentos que também foram observados em amostras de outros países ou que podem ser produzidos em laboratório (quimeras) mostram que o segmento B pode estar contribuindo para a patogênese deste vírus. A origem destes rearranjos pode ser de troca genética com o uso de vacinas vivas ou se aceita a hipótese de que o segmento VP1 dos vvIBDV se originaram de um rearranjo genético de fonte desconhecida, estes rearranjos com segmento vvVP2 e cvVP1, seriam descendentes dos ancentrais dos vvVP1. Apenas um seqüenciamento completo das duas sequências e estudos in vivo poderão caracterizar o papel da VP1 na virulência desta amostra. Assim, o monitoramento contínuo das amostras de IBDV através da caracterização molecular pela análise das sequências dos genes e a detecção de alterações genéticas que possam influenciar a patogenicidade do vírus são de extrema importância, pois geram informações fundamentais que possibilitam e subsidiam o controle desta doença no Brasil
BCCL (1)
Conceição, Rogério Arcuri, 1983-
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP C744a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2014.
Assunto: Escherichia coli
Resumo: Estudos preliminares sobre adesão e invasão mostraram que 100% de 49 amostras de Escherichia coli associada à sepse humana (SEPEC) foram...
Ver mais
Resumo
Resumo: Estudos preliminares sobre adesão e invasão mostraram que 100% de 49 amostras de Escherichia coli associada à sepse humana (SEPEC) foram capazes de aderir e invadir células Vero (Rim de macaco verde africano) e Huvec (Veia umbilical humana). Em análise genotípica, foi observada uma alta prevalência dos genes fimH (98,0%) que codificam para a adesina da fimbria de tipo 1 (F1). No entanto, as cepas analisadas aderiram tanto na presença quanto na ausência de ?-D-manopiranosideo, um inibidor da adesão mediada pela F1. Por esse motivo foram analisadas as proteínas de membrana externa de SEPEC, com o objetivo de se avaliar potenciais fatores adesão e invasão dessas cepas. Por técnicas de proteômica, foram identificadas três proteínas de SEPEC com afinidade a glicoproteínas celulares: OmpA (Proteína de membrana A); FimA (Subunidade maior da fimbria do tipo 1) e YdeR (Subunidade menor da fimbria do tipo 9 - F9). Esses dados foram coerentes com a análise genotípica das amostras SEPEC, pois foi observada uma alta porcentagem dos genes que codificam para as três proteínas descritas anteriormente, sendo que 100% das amostras foram ompA+, 98,0% foram fimA+ e 100% foram ydeR+. Os ensaios de adesão e invasão de SEPEC (OmpA+/ F1+) em células Vero e Huvec mostraram que ?-D-manopiranosideo e GlcNAc, quando atuando juntos, agem como potentes inibidores da adesão e invasão, sugerindo que essas moléculas poderiam estar ocupando os sítios de ligação a carboidratos das duas adesinas F1 e/ou OmpA, respectivamente. Para confirmar essa hipótese, mutantes nulos para ?fimA (OmpA+/ F1-) e ?ompA (OmpA-/F1+) foram construídos, e os resultados de adesão e invasão bacteriana foram similares aos obtidos na presença dos inibidores: ?-D-manopiranosideo e GlcNAc. Mutante nulo para a proteína YdeR da fimbria F9 (OmpA+/ F1+), mostrou significativa redução da adesão e invasão bacteriana em células Vero e Huvec (p ? 0,05) somente na presença dos inibidores da adesão mediada por F1 e OmpA: ?-D-manopiranosideo e GlcNAc, respectivamente. Esses dados sugerem que F9 também contribui para a adesão e invasão de SEPEC. Juntos, nossos dados demonstram que os processos de adesão e invasão de SEPEC são dependentes de OmpA, F1 e F9, as quais podem ser complementares, e devem atuar sinergicamente para a adesão e invasão de SEPEC
BCCL (1)
Borges, Isadora Vitti Vieira, 1991-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP B644a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2018.
Assunto: Bactérias - Classificação
Resumo: A taxonomia microbiana evoluiu simultaneamente à Ciência, sobretudo após o surgimento da Biologia Molecular. Apesar do gene RNA ribossomal 16S...
Ver mais
Resumo
Resumo: A taxonomia microbiana evoluiu simultaneamente à Ciência, sobretudo após o surgimento da Biologia Molecular. Apesar do gene RNA ribossomal 16S permitir a obtenção de informações genotípicas acuradas, é necessário o uso de metodologias que possibilitem análises mais profundas de micro-organismos intimamente relacionados. Nesse contexto, a abordagem por Multilocus Sequence Analysis (MLSA) permite uma maior acurácia genética, uma vez que utiliza genes housekeeping para a inferência de parentesco. Assim, o presente estudo teve por objetivo classificar a um nível específico 15 linhagens do gênero Chromobacterium isoladas do Rio Negro (Manaus, Brasil) e do Rio Doce (Minas-Gerais, Brasil) e 7 linhagens Tipo descritas na literatura: C. violaceum (ATCC 12472T), C. pseudoviolaceum (LMG 3953T), C. haemolyticum (DSM 19852T), C. vaccinii (DSM 25150T), C. piscinae (LMG 3947T), C. subtsugae (PRAA4-1T) e C. amazonense (DSM 26508T), utilizando a metodologia de MLSA. Os primers para os genes estruturais atpD, rpoA e rpoB foram desenhados a partir do genoma total de C. violaceum (ATCC 12472T). A partir do sequenciamento dos genes housekeeping foi possível a construção de árvores filogenéticas parciais e árvores filogenéticas com os genes concatenados na seguinte ordem: RNA ribossomal 16S e atpD; RNA ribossomal 16S, atpD e rpoA; RNA ribossomal 16S, atpD e rpoB e RNA ribossomal 16S, atpD, rpoA e rpoB. As filogenias resultantes de diferentes metodologias (Neighboor Joining ¿Kimura 2 parâmetros, Maximum Parsimony, Maximum Likelihood, Minimum Evolution e UPGMA) com 1000 repetições de bootstrap apresentaram topologias similares. Conforme a análise por MLSA as cepas CBMAI 301, CBMAI 302, CBMAI 303, CBMAI 304, CBMAI 306, CBMAI 307, CBMAI 308 e CBMAI 309 pertencem a espécie C. violaceum; as linhagens CBMAI 589, CBMAI 590 e CBMAI 592 representam uma provável nova espécie relativamente próxima de C. vaccinii. As linhagens CBMAI 593 e CBMAI 595 formaram um clado separado de todas as espécies descritas, e a linhagem CBMAI 594 não agrupou com nenhuma das espécies do gênero. A partir desse trabalho foi possível concluir que a abordagem por MLSA é promissora para a resolução filogenética de espécies intimamente relacionadas e que os genes conservados atpD e rpoA constituem bons marcadores moleculares para o gênero Chromobacterium
Suarez Lizarazo, Frank Uriel, 1996-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP Su12a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2023.
Assunto: Xilose isomerase
Resumo: Apesar dos inúmeros esforços para viabilizar a produção de bioetanol hemicelulósico, o metabolismo de pentoses pela levedura Saccharomyces...
Ver mais
Resumo
Resumo: Apesar dos inúmeros esforços para viabilizar a produção de bioetanol hemicelulósico, o metabolismo de pentoses pela levedura Saccharomyces cerevisiae permanece como um dos limitantes do processo. Engenharia metabólica na direção de melhorar este fenótipo é foco em diversos projetos de pesquisa, quase sempre limitado à forte superexpressão ou deleção de genes. Mesmo que esta estratégia tenha se demonstrado bastante eficaz, ainda persiste a importância de se obter novos alvos que otimizem o fenótipo a partir de níveis moderados de expressão. Portanto, este projeto visa identificar tais alvos que resultem na melhora do consumo de xilose em cepas de S. cerevisiae. Para tanto, foi usado o sistema CRISPR-dCas9, a partir de uma biblioteca de RNAs guias (sgRNA) complementares à região promotora de 969 genes. Tal ferramenta permite a regulação bidirecional (ativação ou repressão) de todos genes em S. cerevisiae, e uma mudança de fenótipo pode ser correlacionada às sequências de sgRNA identificadas nas células expressando estes vetores. As cepas utilizadas para esta investigação foram LVY34.4 e LVY27, ambas derivadas da levedura de bioetanol PE-2 e modificadas para consumo de xilose, sendo a primeira submetida a um ensaio de evolução adaptativa em laboratório. Para avaliar o efeito de tais bibliotecas no consumo de xilose de ambas as cepas, foi aplicado um ensaio de fenotipagem high-throughput de colônias isoladas transformadas, e um ensaio de enriquecimento de uma população transformada. Para o primeiro cenário, foi identificado que a repressão de genes no metabolismo de aminoácidos e nucleotídeos e a ativação de genes no metabolismo de energia e cofatores causaram maior variação nos parâmetros de crescimento cinético da cepa LVY34.4. Enquanto isso, a repressão e ativação de genes presentes no metabolismo de carboidratos e lipídios tiveram um efeito mais positivo na OD final da LVY27. A partir do ensaio de enriquecimento, foi observada uma mudança no padrão de crescimento das cepas, cujo DNA foi extraído para sequenciamento NGS dos sgRNAs enriquecidos em xilose (dados em análise). A identificação desses alvos genéticos pode levar à descoberta de novos genes que possivelmente foram negligenciados em abordagens binárias de otimização do metabolismo de xilose em S. cerevisiae
Arquitetura, interações e análise genômica das Mur ligases
Shirakawa, Karina Tamie, 1993-
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP Sh65a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2023.
Assunto: Peptidoglicano
Resumo: O peptidoglicano (PG) é um componente essencial da parede celular bacteriana, e por isso tem sido um dos principais alvos para a produção de...
Ver mais
Resumo
Resumo: O peptidoglicano (PG) é um componente essencial da parede celular bacteriana, e por isso tem sido um dos principais alvos para a produção de antibióticos, desde a implementação da penicilina. As Mur ligases (MurC, MurD, MurE e MurF) são responsáveis pela etapa inicial da biossíntese do PG no citoplasma, e devido as suas características similares e seu envolvimento em um possível subcomplexo citoplasmático, essas enzimas têm sido extensivamente estudadas para o desenvolvimento de novos agentes antibacterianos. Na maioria das bactérias, as Mur ligases são expressas de forma isolada, como no caso de Streptococcus pneumoniae; porém, em algumas espécies certos genes mur são fusionados, como a fusão murEmurF em Bordetella pertussis. Desta forma, este trabalho teve como objetivo analisar as interações e isolar um complexo Mur de dois patógenos humanos, S. pneumoniae (Gram-positiva) e B. pertussis (Gram-negativa). Utilizando diferentes técnicas, foi demonstrada a interação transiente entre as Mur ligases tanto de S. pneumoniae quanto de B. pertussis, apresentando os primeiros indícios dessa interação em B. pertussis. Análises de bioinformática revelaram a existência de diferentes fusões das proteínas Mur, sendo MurE-MurF a mais abundante encontrada. Essas fusões Mur apresentam dois tipos de arquitetura em potencial: com um linker conectando as proteínas, ou com as proteínas justapostas conectadas por suas extremidades C e N-terminal. Nesta tese foi descrita a primeira estrutura de uma fusão MurE-MurF de B. pertussis, a qual apresenta uma estrutura peculiar não-predita pelos bancos de dados, representando uma sub-arquitetura das fusões Mur justapostas. Além disso, identificamos resíduos importantes envolvidos na interação entre MurE e MurF em MurE-MurF, que parece ter um certo grau de conservação nas demais fusões MurE-MurF e nas proteínas isoladas. Essa tese fornece importantes avanços na compreensão da interação entre essas enzimas, e na formação do subcomplexo citoplasmático do PG, que podem auxiliar nos estudos e elaboração de inibidores almejando as Mur ligases
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP Sa29a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2013.
Assunto: Agentes antivirais
Resumo: Produtos naturais isolados a partir de invertebrados e organismos marinhos tem sido objeto de pesquisas contínuas ao longo dos últimos...
Ver mais
Resumo
Resumo: Produtos naturais isolados a partir de invertebrados e organismos marinhos tem sido objeto de pesquisas contínuas ao longo dos últimos cinquenta anos, principalmente devido à sua complexidade estrutural e potentes atividades biológicas. O presente trabalho teve como proposta ampliar e aprofundar a investigação de substâncias bioativas em extratos de organismos marinhos, junto ao IQSC-USP/Projeto temático, realizando bioensaios de atividade antiviral no laboratório de virologia da Unicamp. Com o objetivo de realizar uma triagem para pesquisar substâncias com ação antiviral, foram eleitas duas espécies de vírus de destaque na avicultura, o Metapneumovirus aviário (aMPV) e o vírus da Doença de Newcastle (NDV), representantes da família Paramyxoviridae. As propriedades em comum dos vírus dentro das respectivas subfamílias, como a organização genômica, sequências das proteínas e suas atividades biológicas, permitem a utilização do aMPV como modelo de estudo para importantes agentes infecciosos da subfamília Pneumovirinae, e o NDV da subfamília Paramyxovirinae. Para a triagem de compostos antivirais foi realizada a avaliação in vitro na linhagem celular Chicken Embryo Related (CER) para a propagação dos vírus e analisar os resultados de inibição viral frente a diferentes extratos e substâncias. Dos cento e vinte e cinco extratos testados frente ao aMPV, sete demonstraram ser ativos, e seis com alto potencial antiviral. Inicialmente, cento e quarenta e sete extratos foram testados frente ao NDV, porém, o resultado foi inconclusivo devido a problema com o título da amostra viral. Assim, os sete extratos ativos e os seis com alto potencial antiviral contra o aMPV foram testados quanto à capacidade de inibição do NDV. Apesar das similaridades dos vírus da família Paramyxoviridae, os extratos não tiveram atividade contra o NDV, como ocorreu frente ao aMPV. As amostras ativas foram estudadas em três tipos de tratamento a fim de determinar os possíveis mecanismos de ação dos extratos: Pré-tratamento, fases de adsorção e/ou penetração do vírus na célula; Pós-tratamento, etapas intracelulares de replicação do vírus; e Inativação Viral. Pela análise visual do efeito citopático, os sete extratos ativos contra aMPV, quatro interrompem as etapas intracelulares de replicação do vírus, dois agem nas fases de adsorção e/ou penetração do vírus à célula, e um não tinha quantidade suficiente para realizar o teste. Com a finalidade de avaliar os possíveis mecanismos de ação com maior objetividade, menor risco de contaminação e alta especificidade, testou-se a metodologia de reação em cadeia da polimerase (PCR) em tempo real. Utilizando um composto puro (pirocina A) frente ao aMPV em CER, a metodologia se demonstrou eficiente. Esse dado foi confirmando pela diminuição de RNA viral quando ocorre a atividade antiviral, dando indícios de atuação do composto em etapas intracelulares de replicação do aMPV. A detecção de extratos com atividade antiviral nas situações testadas neste trabalho corrobora o valor da biodiversidade marinha como fonte de produtos promissores na terapêutica de enfermidades virais. Portanto, a necessidade de estudos sobre esses vírus e do desenvolvimento de novos insumos a serem utilizados nos seus controles é de grande importância ponderado a crescente projeção da indústria avícola brasileira no comércio mundial
BCCL (1)
TESE - Português
Número de chamada: T/UNICAMP P134a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2015.
Assunto: Agentes antivirais
Resumo: As infecções virais acometem tanto humanos quanto animais. Problemas associados a falta de vacinas e o desenvolvimento de resistência aos...
Ver mais
Resumo
Resumo: As infecções virais acometem tanto humanos quanto animais. Problemas associados a falta de vacinas e o desenvolvimento de resistência aos medicamentos estimulam a pesquisa por compostos antivirais. As bactérias são responsáveis pela produção de inúmeros compostos com atividades biológicas importantes, portanto, esse trabalho teve como objetivo a busca por compostos antivirais produzidos por bactérias coletadas em cupinzeiros. Extratos provenientes de diferentes isolados de bactérias associadas ao cupim foram avaliados quanto a atividade antiviral in vitro frente a três vírus de importância para a saúde humana e animal: herpes humano tipo 1 (HHV-1), calicivírus felino (FCV)- modelo para o norovírus humano - e o vírus da diarréia viral bovina (BVDV) ¿ modelo para o vírus da hepatite C. Dos 90 extratos analisados, 10% apresentaram porcentagem de inibição (PI%) ? 98% contra pelo menos um dos vírus: cinco foram ativos frente ao HHV-1, três apresentaram atividade contra o FCV e dois foram ativos frente ao BVDV. Das espécies ativas, seis pertencem ao gênero Streptomyces, com uma delas identificada como S. chartreusis e quatro identificadas como sendo do gênero Achromobacter. Três extratos apresentaram índice de seletividade (IS) acima de 3,5 contra o HHV-1 com destaque ao CDPA10 (Streptomyces sp) com IS=17,10. Frente ao FCV e o BVDV dois extratos foram considerados promissores: o LC22 (IS=11,00), identificado como Streptomyces sp e o CDPA27 (S. chartreusis) com IS=3,5, respectivamente. Os extratos que destacaram-se quanto aos valores e IS foram também avaliados em uma triagem de mecanismo de ação. Dos três extratos com IS acima de 3,5 frente ao HHV-1, um apresentou atividade antiviral no pós tratamento. Os outros, incluindo o CDPA10 agem como inativadores virais. O extrato LC22, ativo contra o FCV apresentou atividade no pós tratamento e também como inativador viral. Por fim, o extrato proveniente do S. chartreusis (CDPA27), agiu no pós tratamento frente ao BVDV. Esses três extratos, CDPA10, LC22 e CDPA27 foram selecionados para o fracionamento em coluna C18 fase reversa em ordem crescente de metanol, originando seis frações. Todas as frações foram avaliadas contra seus respectivos vírus e como resultado foi possível observar que a fração 6 (100% metanol) foi a mais promissora dos três extratos. Essa fração do CDPA10 e do CDPA27, ativos contra o HHV-1 e BVDV respectivamente, apresentaram valor de PI=99%, enquanto a fração 6 do extrato LC22 (ativo contra o FCV) apresentou PI=90%. Nas avaliações quanto ao IS dessas frações promissoras, observou-se que os valores aumentaram consideravelmente tanto para o CDPA10 como para o CDPA27, já a fração do LC22 teve o valor de IS reduzido para 3,24. Finalmente, todos os extratos e suas frações promissoras foram analisados por cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massa (CG-MS). Esta análise, quando comparada aos compostos já descritos na biblioteca NIST/2005, não permitiu a identificação dos compostos devido a baixa similaridade. Estudos mais detalhados devem ser realizados a fim de identificar as espécies bacterianas e seus respectivos compostos ativos. Os resultados obtidos revelam novas perspectivas para a pesquisa antiviral a partir de produtos naturais e demonstra o potencial antiviral de compostos produzidos por bacterias associadas ao cupim
Bispo-dos-Santos, Karina, 1993-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP B542a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2022.
Assunto: Agentes antivirais
Resumo: As doenças infecciosas ocupam a quarta principal causa de morte e de incapacitância no mundo, caracterizando-se como uma séria ameaça à saúde...
Ver mais
Resumo
Resumo: As doenças infecciosas ocupam a quarta principal causa de morte e de incapacitância no mundo, caracterizando-se como uma séria ameaça à saúde pública e à economia global. No Brasil, apesar das várias epidemias arbovirais que emergiram nos últimos anos, casos de doença febril associados ao arbovírus Oropouche Orthobunyavirus (OROV) continuam a acontecer, principalmente na região Amazônica. A entrada de OROV em células hospedeiras é dependente da endocitose mediada por clatrina (EMC), um processo altamente orquestrado e que envolve a atividade da quinase 1 associada à proteína adaptadora 2 (AAK1) e da quinase associada à ciclina G (GAK). Até o momento, não há tratamento aprovado para o combate da febre do Oropouche e, uma das dificuldades encontradas trata-se da alta diversidade genética entre ortobunyavírus, o que torna desafiador o desenvolvimento de compostos com atividade antiviral direta. Dado esse contexto, o foco desse trabalho foi avaliar o efeito antiviral contra OROV de compostos com atuação direcionada às estruturas do hospedeiro, principalmente inibidores de AAK1 e GAK em células Vero infectadas. Dos sete compostos analisados, seis apresentaram atividade antiviral. Os melhores resultados foram obtidos com o inibidor de ambas as quinases, AAK1 e GAK, nas condições de pré-tratamento e nos períodos de 0h e 2h após o tempo de adsorção. O LP935509, composto comercial com atividade inibitória de AAK1 e GAK apresentou IC50= 13,20 µM, enquanto os compostos SGC-GAK-N, SGC-AAK1-1 e SGC-AAK1-N apresentaram IC50 de 90,58, 104,60 e 403 µM respectivamente. A cloroquina inibiu OROV somente em altas concentrações, com um IC50 de 4.611 µM, SGC-GAK-1 inibiu 1log10 de OROV a 2,5 µM e a ribavirina não apresentou atividade antiviral nas concentrações testadas. Desse modo, acreditamos que nossos resultados ilustram o papel de AAK1 e GAK, da endocitose mediada por clatrina e da acidificação endossomal para a internalização de OROV
Bastos, Juliana Cristina Santiago, 1985-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP B297a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2013.
Assunto: Vírus da hepatite C.
Resumo: O vírus da Hepatite C (família Flaviviridae, gênero Hepacivirus) é causador de infecções crônicas em humanos, que podem evoluir para quadros...
Ver mais
Resumo
Resumo: O vírus da Hepatite C (família Flaviviridae, gênero Hepacivirus) é causador de infecções crônicas em humanos, que podem evoluir para quadros de cirrose hepática e carcinoma hepatocelular. Até o momento, não há vacina disponível contra essa infecção e o tratamento disponível é caro, tem eficácia limitada e gera uma vasta gama de efeitos secundários, o que dificulta a continuidade do tratamento. Como esse vírus não replica eficientemente em cultura de células e em animais, o vírus da diarréia viral bovina é utilizado como modelo substituto para ensaios de avaliação de atividade antiviral e em ensaios de mecanismo de ação. A partir de invertebrados e micro-organismos marinhos, foram preparados extratos e frações, e algumas substâncias foram isoladas para a avaliação da sua possível atividade antiviral. Dos 422 testados, 5% foram considerados promissores e, destes, 20% mostraram-se ativos apresentando uma proteção de mais de 97% às células frente ao vírus. Os melhores resultados foram obtidos dos extratos produzidos a partir das amostras de esponjas Hyrtios sp. (BA07ES-56: PI=99%, IS=25), Aaptos sp. (BA07ES-59: PI=99%, IS=8,25) e de bactérias Bacillus sp. (555: PI=98%, IS>18; 584: PI=98%, IS=27) isoladas da esponja Petromica citrina. Os extratos e compostos promissores foram capazes de atuar em diversas etapas do ciclo replicativo viral (adsorção, penetração, etapas intracelulares do ciclo replicativo e também inativação da partícula viral), levando à sua interrupção quase completa nas condições analisadas. Desse modo, diversas substâncias presentes nesses organismos estudados são ativas e podem levar ao desenvolvimento de fármacos que garantam uma terapia alternativa para o tratamento da hepatite C.
BCCL (1)
Jacinto, Gislaine Santos, 1992-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP J119a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2024.
Assunto: Cobre
Resumo: Agentes inorgânicos como os metais cobre (Cu) e prata (Ag) se destacam há milênios por apresentarem atividade biocida. Em meio a pandemia...
Ver mais
Resumo
Resumo: Agentes inorgânicos como os metais cobre (Cu) e prata (Ag) se destacam há milênios por apresentarem atividade biocida. Em meio a pandemia causada pelo SARS-CoV-2, esses metais têm sido ainda mais explorados e associados a uma variedade de novas tecnologias e soluções adaptadas para diminuir os riscos de contrair o vírus causador da COVID-19. Neste estudo, foram analisados quanto à citotoxicidade e atividade virucida, 25 produtos cujos fabricantes alegam conter Ag ou nanopartículas de prata (AgNPs) na composição tais como desinfetantes, antissépticos, tintas, verniz, polímeros, tecidos, máscaras respiratórias e insumos para incorporação à materiais. Os desinfetantes e antissépticos foram analisados quanto à estabilidade do princípio ativo e durabilidade do efeito virucida após longa exposição ambiental. Outros 16 materiais contendo cobre na composição com função de revestimento (tintas, polímeros, folha laminada), vestuário, reparação de tecidos (biomateriais) e padrões comerciais também foram analisados. Parte dos materiais foi selecionada para caracterização elementar via Espectroscopia de Fotoelétrons por Raios X (XPS) e caracterização físico-química via Espalhamento Dinâmico de Luz (DLS), onde foi mensurado o diâmetro hidrodinâmico, índice de dispersão e potencial zeta. A concentração de parte das amostras foi mensurada por Análise de Rastreamento de Nanopartículas (NTA). Os materiais foram testados quanto a atividade virucida contra o coronavírus MHV-3, vírus modelo substituto para SARS-CoV-2, seguindo a norma British Standard and European Standard (BS EN). As alterações morfológicas na partícula viral, após interação com os metais, foram avaliadas por crio microscopia eletrônica (Cryo-ME). Os resultados apontaram que os desinfetantes baseados em Ag mantiveram o efeito contra o coronavírus mesmo após 30 dias de exposição a temperatura do ambiente do produto. Tintas à base de Ag e AgNPs demonstraram atividade contra o coronavírus mesmo em baixas concentrações, a partir de 24 ppm. Emulsões aquosas contendo AgNPs inativaram o coronavírus na concentração de 8,84x1010 nanopartículas por mL. O potencial zeta negativo de parte das amostras contendo Ag parece implicar em maior grau de interação entre o vírus e AgNPs, desestabilizando as partículas virais e potencializando a inativação. Da mesma forma, a tinta contendo Cu em baixa concentração (30 a 40 ppm) também foi eficiente na inativação viral. Os resultados apontaram que nanopartículas de óxido de cobre (CuONPs, nm) apresentaram um maior potencial de inativação do vírus comparado a micropartículas de CuO (µm), sendo capaz de inativar inclusive vírus não envelopados, como o Feline calicivirus (FCV). As imagens do MHV-3 após contato com suspensão aquosa de AgNPs demostraram danos ao envelope viral e internalização de nanopartículas. Após o contato com superfície revestida com CuO, extensos danos ao capsídeo viral puderam ser observados, presumivelmente como resultado da ação direta ou indireta de íons de cobre
Avaliação da atividade bactericida e bacteriostatica da violaceina
DISSERTAÇÃO - r d
Número de chamada: T/UNICAMP M581a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2008.
Assunto: Violaceina
Resumo: A violaceína é um composto indol, de intensa cor violeta que é produzido por Chromobacterium violaceum, uma bactéria ubíqua de zonas tropicais...
Ver mais
Resumo
Resumo: A violaceína é um composto indol, de intensa cor violeta que é produzido por Chromobacterium violaceum, uma bactéria ubíqua de zonas tropicais e subtropicais. Esta molécula apresenta inúmeras propriedades antimicrobianas, tais como agente antimicótico, antiviral e atividade contra certos protistas. Observações importantes apontam para uma atividade bactericida considerável, tornando premente um estudo mais aprofundado a cerca desta propriedade. No presente trabalho sondou-se a sensibilidade a este composto para algumas bactérias de interesse médico e um fitopatógeno, sua cinética de inibição do crescimento bacteriano, assim como se obtiveram importantes pistas sobre o mecanismo de ação. Foi encontrada atividade inibitória considerável para Staphylococcus aureus e Staphylococcus epidermidis, com uma maior inibição durante a fase estacionária, assim como para Xanthomonas axonopodis p.v passifloraceae. Através de micrografias eletrônicas pôde-se constatar profundas alterações na parede celular em S. aureus, indicando esta estrutura como sítio de atuação da violaceína, assim como através de espectrometria de massa (MALDI-TOF) a identificação de proteínas diferencialmente expressas por S. aureus na presença ou ausência de violaceína, indicando uma grande perturbação no metabolismo bacteriano, com inibição a alguns fatores de patogenicidade e também inibição da síntese protéica
BCCL (1)
Cauz, Ana Carolina Guimarães, 1987-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP C313a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2015.
Assunto: Estafilococos aureos
Resumo: Isolados de Staphylococcus aureus correspondem a importantes patógenos para humanos e outros mamíferos, frequentemente associados a doenças em...
Ver mais
Resumo
Resumo: Isolados de Staphylococcus aureus correspondem a importantes patógenos para humanos e outros mamíferos, frequentemente associados a doenças em tecidos moles, tanto em infecções localizadas quanto sistêmicas. Tais infecções por S. aureus são geralmente de difícil tratamento devido à ocorrência de resistência antimicrobiana. Atualmente, linhagens de S. aureus resistentes à meticilina (MRSA) são isoladas em infecções e uma das últimas drogas de escolha para tratar essas doenças é a vancomicina, um anitbiótico glicopeptídeo. Entretanto, o isolamento de S. aureus com hetero-resistência e resistência intermediária à vancomicina (VISA e HVISA) tem sido descrito em diversos países. Dessa forma, a descoberta e caracterização de novas drogas para tratar infecções por S. aureus é uma necessidade urgente. Neste trabalho, há a descrição da atividade antimicrobiana da violaceína, uma molécula isolada de algumas espécies de bactérias ambientais, para linhagens VISA e hetero-VISA (HVISA) que se apresentaram resistentes a 24 antibióticos diferentes, o que indica um fenótipo de multirresistência (MRD). Os dados indicam uma atividade antimicrobiana expressiva da violaceína, sendo este efeito também observado através da realização de ensaios de efeito pós-antibiótico e curvas de tempo-morte. O efeito antimicrobiano da violaceína para linhagens de S. aureus resistentes a 24 antibióticos pertencentes a diferentes classes indicam um mecanismo distinto de ação da violaceína. Estes resultados sugerem a violaceína como uma droga em potencial para tratar infecções por S. aureus MRD, incluindo linhagens VISA e HVISA
BCCL (1)
Amorim, Mariene Ribeiro, 1992-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP Am68a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2019.
Assunto: Oropouche orthobunyavirus
Resumo: Vírus Oropouche (OROV) são vírus emergente transmitidos por artrópodes que têm demonstrado grande potencial de disseminação e eficiência na...
Ver mais
Resumo
Resumo: Vírus Oropouche (OROV) são vírus emergente transmitidos por artrópodes que têm demonstrado grande potencial de disseminação e eficiência na transmissão. Fatores que facilitam sua dispersão incluem aumento da mobilidade e expansão dos sistemas de transporte, expansão da densidade populacional, e principalmente desmatamento de florestas e mudanças na vegetação onde circulam os vetores virais. Os principais sintomas apresentados pela febre do Oropouche são cefaleia, mialgia, artralgia e exantema. Existem ainda relatos de pacientes que apresentaram sintomas hemorrágicos, ou complicações neurológicas associados a detecção de OROV. A modulação da resposta de monócitos e células dendríticas no início da infecção são eventos patognomônicos chaves para a progressão da infecção e desenvolvimento de doenças agudas e manifestações clínicas tardias durante as infecções virais. Dessa forma, foi analisado nesse trabalho a capacidade de replicação e persistência de OROV em PBMCs humanas, e a modulação da resposta imune gerada por essas células in vitro. Foi observado aumento da expressão de interferons do tipo I do tipo II e aumento na expressão de ISGs importantes na resposta antiviral, associado à diminuição gradativa da detecção de RNA viral. Apesar da resposta imune inata aparentemente conter a infecção in vitro, foi observado por meio de RNA PrimeFlow e citometria de fluxo que genoma viral ainda pode ser encontrado no interior de monócitos e linfócitos em pequenas quantidades, indicando a possibilidade dessas células servirem como cavalo de troia em microambientes específicos. Além disso, como nesse estudo foram utilizadas PBMCs doadores saudáveis, não é improvável que OROV possa se replicar nessas células em casos de algum tipo de imunodeficiência
Goes, Isabella Carolina Rodrigues dos Santos, 1996-
DISSERTAÇÃO - Português
Número de chamada: T/UNICAMP G553a
Publicação: Campinas, SP : [s.n.], 2022.
Assunto: Mariposa
Resumo: "Galleria mellonella" é uma mariposa da ordem Lepidoptera, descrita nos últimos anos como modelo de infecção in vivo na fase larval. G....
Ver mais
Resumo
Resumo: "Galleria mellonella" é uma mariposa da ordem Lepidoptera, descrita nos últimos anos como modelo de infecção in vivo na fase larval. G. mellonella tem um ciclo de vida curto, tamanho pequeno e desenvolvimento em 28°C - 37°C, o que a torna um bom modelo para infecções bacterianas. Além disso, seu sistema imunológico consiste em respostas contra patógenos, composta por resposta imune celular e resposta imune química. Apesar disso, ainda não é bem demonstrado o paralelismo entre o grau de virulência observados no modelo de G. mellonella comparado a outros modelos, indicando que estudos adicionais são necessários para sua completa validação. "Salmonella Typhimurium" é uma bactéria Gram-negativa enteropatogênica responsável por inúmeras mortes e uma grande preocupação para os serviços de saúde pública por sua capacidade de causar desde gastroenterites simples até septicemia. A transmissão ocorre por meio de alimentos e água contaminados e é capaz de infectar galinhas, suínos, bovinos e humanos. Essa preocupação levou a diversos estudos ao longo dos anos, inclusive possibilidade de vacina oral utilizando mutantes atenuados de "Salmonella". Muitas linhagens de "Salmonella" são construídas, avaliadas e descritas em outros modelos de infecção na literatura. Portanto, este estudo teve como objetivo demonstrar que G. mellonella é um modelo eficaz para analisar a atenuação de virulência de linhagens com mutação nos genes deltacyadeltacrp, deltacyadeltacrpdeltaasd e deltaaroA, deltaaroAdeltaasd, que são mutações bem descritas e estão entre os mais utilizados como linhagens mutantes atenuadas de "Salmonella" enterica. Nossos resultados demonstraram que a porcentagem de larvas sobreviventes é superior em larvas inoculadas com linhagens mutantes e as taxas de multiplicação e sobrevivência da bactéria no interior das larvas foi menor para mutantes em comparação com as linhagens selvagens. Além disso, larvas inoculadas com a linhagem selvagem revela uma contagem de hemócitos menor, mielinização maior, e os danos teciduais foram mais acentuados com pontos de mielinização maiores que larvas inoculadas com mutantes deltaaroA e deltaaroAdeltaasd, reforçando a atenuação da virulência dessas linhagens. Portanto, a utilização desse modelo de infecção é eficaz como triagem inicial para verificar a atenuação da virulência dessas linhagens e futuras linhagens, com potencial vacinal