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Type: Artigo de periódico
Title: Differentiation and numerical analysis of oral yeasts based on SDS-Page profiles. Influence of the culture media on the whole-cell protein extracts
Title Alternative: Proteínas de células totais de leveduras SDS-Page e análise numérica
Author: HÖFLING, J. F.
ROSA, E. A. R.
PEREIRA, C. V.
BORIOLLO, M. F. G.
RODRIGUES, J. A. O.
Abstract: The application of gel electrophoresis and numerical analysis of yeast soluble proteins analysis to the investigation of 12 oral yeast strains belonging to five species is described. It involves one-dimensional electrophoresis of SDS-solubilized whole-cell proteins using different culture media for the cultivation of the cells, integration densitometries in the areas of the gels and percentages of the proteins extraction. These extracts were prepared from four isolates of Candida albicans, two of C. tropicalis, C. guilliermondii, C. parapsilosis and C. krusei. The extracts from whole-cells proteins using different culture media for the cultivation of the cells were fractionated by slab electrophoresis using a discontinuous buffer system. The corresponding patterns showed at least 36 polypeptides in the range of 14.4-200 kDa. Different isolates of each species were clearly different in each of the five species. The data obtained suggest that different nutritional compositions led to the expression of different proteins derived from alternatives metabolic pathways expressed by the electrophoretic profiles. The construction of a database of protein fingerprints and numerical analysis based on such data, may have some implications in the classification and identification of such species with epidemiological, ecological and taxonomic purposes. A well defined or synthetic culture media seems to be much properly.
Neste trabalho são descritas a aplicação de gel de poliacrilamida e a análise numérica no estudo de proteínas solúveis na investigação de 12 amostras de leveduras orais, pertencentes a 5 espécies. Aplicou-se a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida na análise de proteínas de células totais, usando-se diferentes tipos de meios de cultura de células leveduriformes; densitometria de integralização da área dos géis, com a porcentagem de extração das proteínas para cada amostra de meio de cultura; além dos respectivos dendrogramas comparativos. Foram preparados extratos a partir de quatro isolados de C. albicans, dois de C. tropicalis, C. guilliermondi, C. parapsilosis e C. krusei. Os extratos foram fracionados por eletroforese em gel de acrilamida (slab), usando o sistema de tampão descontínuo. Os padrões de bandas protéicas mostraram pelo menos 36 polipeptídios entre 14.4-200 kDa. Dentre os diversos isolados de cada espécie, observaram-se diferenças significativas em cada uma das cinco espécies estudadas. Os dados obtidos sugerem que diferentes composições nutricionais presentes nos meios determinam a ex-pressão de diferentes proteínas, derivadas de mecanismos metabólicos alternativos, expressos nos perfis eletroforéticos. A construção de um banco de dados de proteínas e a análise numérica com base em dados dessa natureza podem ter implicações na diferenciação de espécies, com objetivo epidemiológico, ecológico e taxonômico. Meios nutricionalmente definidos ou sintéticos seriam mais apropriados.
Subject: leveduras orais
SDS-Page
análise numérica
diferenciação
extratos protéicos
meios de cultura
oral yeasts
SDS-Page
numerical analysis
differentiation
protein extracts
culture media
Editor: Instituto Internacional de Ecologia
Rights: aberto
Identifier DOI: 10.1590/S1519-69842001000300021
Address: http://dx.doi.org/10.1590/S1519-69842001000300021
http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-69842001000300021
Date Issue: 1-Aug-2001
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