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Type: DISSERTAÇÃO DIGITAL
Degree Level: Mestrado
Title: Análise genética e citogenética do complexo Physalaemus cuvieri– Physalaemus ephippifer (Anura, Leptodactylidae) : Genetic and cytogenetic analyses of the Physalaemus cuvieri-Physalaemus ephippifer species complex (Anura, Leptodactylidae)
Title Alternative: Genetic and cytogenetic analyses of the Physalaemus cuvieri-Physalaemus ephippifer species complex (Anura, Leptodactylidae)
Author: Tenório, Renata de Oliveira, 1989-
Advisor: Lourenço, Luciana Bolsoni, 1972-
Abstract: Resumo: Análises genéticas baseadas em sequências nucleotídicas têm se mostrado muito relevantes para entender a diversidade críptica de anuros, especialmente quando reúne dados de múltiplos locos. Atualmente, o gênero Physalaemus possui 48 espécies reconhecidas e suspeita-se da presença de algumas espécies crípticas, ainda não descritas. Análises filogenéticas e citogenéticas sugeriram a existência de pelo menos duas espécies crípticas ainda não descritas, proximamente relacionadas filogeneticamente a Physalaemus cuvieri e a Physalaemus ephippifer, podendo chegar a sete o número de espécies nesse grupo. A ausência da informação sobre a localidade-tipo de P. cuvieri dificulta a revisão taxonômica desse complexo de espécies e, por isso, até o momento as espécies delimitadas com base em sequências de DNA passaram a ser referidas como Physalaemus sp. - clado Oeste do Pará, Physalaemus sp. - clado Viruá), Linhagens 1A, 1B, 2 e 3 de "P. cuvieri", P. ephippifer. Uma dúvida que ainda persiste em relação ao número de espécies contidas nesse complexo se refere a P. ephippifer e à Linhagem 1 de "P. cuvieri". Com base em sequências de DNA mitocondrial, foi identificada baixa distância genética entre P. ephippifer e a Linhagem 1 de "P. cuvieri". No entanto, existem diferenças citogenéticas entre esses grupos, principalmente em relação a cromossomos sexuais, pois apenas P. ephippifer apresenta heteromorfismo sexual cromossômico. Para entender melhor a relação entre esses dois grupos, se torna de suma importância o estudo de espécimes que ocorrem nas áreas situadas entre as localidades de ocorrência da Linhagem 1 de "P. cuvieri" e de P. ephippifer. No presente trabalho, com base em sequências de DNA mitocondrial, marcadores do tipo RAD-seq e dados cariotípicos, foram analisados espécimes dessa região, com o intuito de avaliar a hipótese de contato secundário entre as linhagens mencionadas. Os resultados mostraram que existem dois haplogrupos mitocondriais dentre os espécimes daquela região, um deles agrupado com P. ephippifer e o outro com a Linhagem 1 de "P. cuvieri". Todavia, os agrupamentos inferidos com base nos marcadores nucleares do tipo RAD-seq foram incongruentes com aqueles apontados pelos dados mitocondriais, fortalecendo a hipótese de hibridação/introgressão envolvendo P. ephippifer e a Linhagem 1 de "P. cuvieri". Os resultados citogenéticos revelaram um cariótipo exclusivo aos indivíduos da região em estudo, e nenhuma evidência da presença de híbridos de primeira geração foi encontrada. Assim, foi possível inferir que há evidência de contato secundário entre P. ephippifer e a Linhagem 1 de "P. cuvieri na área estudada" e que esse contato deve ter ocorrido há algum tempo.

Abstract: Genetic analyses based on nucleotide sequences are very relevant for understanding cryptic anuran diversity, especially when employed multiple loci data. Currently, the genus Physalaemus has 48 recognized species and it is suspected the presence of some cryptic species, not yet described. Phylogenetic and cytogenetic analyzes have suggested the existence of at least two undescribed cryptic species, closely related phylogenetically to Physalaemus cuvieri and Physalaemus ephippifer, and the number of species in this group may reach seven. The lack of information about the P. cuvieri type-locality makes it difficult to taxonomically revise this species complex and, so far, species delimited based on DNA sequences have been referred to as Physalaemus sp. - Western clade of Pará, Physalaemus sp. Viruá clade), Lineages 1A, 1B, 2 and 3 of "P. cuvieri", P. ephippifer. One question that still persists regarding the number of species contained in this complex refers to P. ephippifer and Lineage 1 of "P. cuvieri". Based on mitochondrial DNA sequences has been identified as a low genetic distance between P. ephippifer and "P. cuvieri". However, great cytogenetic variation exists between these groups, especially about sex chromosomes, because only P. ephippifer presents chromosomal sexual heteromorphism. To better understand the relationship between these two groups, it is of paramount importance to study specimens that occur in the areas between the locations of occurrence of Lineage 1 of "P. cuvieri" and by P. ephippifer. In the present study, based on mitochondrial DNA sequences, RAD-seq markers and karyotypic data, specimens from this region were analyzed to evaluate the hypothesis of secondary contact between the mentioned strains. The results showed that there are two mitochondrial haplogroups among the specimens of that region, one of them grouped with P. ephippifer and the other with "P. cuvieri". However, the inferred clusters based on RAD-seq nuclear markers were inconsistent with those indicated by mitochondrial data, raising the hypothesis of hybridization/introgression involving P. ephippifer and Lineage 1 of "P. cuvieri". The cytogenetic results revealed an exclusive karyotype to individuals from the region under study, and no evidence of the presence of first generation hybrids was found. Thus, it was possible to infer that there is evidence of secondary contact between P. ephippifer and Lineage 1 of "P. cuvieri" in the area studied and that this contact must have occurred some time ago.
Subject: Hibridação
Citogenética
Physalaemus
Language: Português
Editor: [s.n.]
Citation: TENÓRIO, Renata de Oliveira. Análise genética e citogenética do complexo Physalaemus cuvieri– Physalaemus ephippifer (Anura, Leptodactylidae): Genetic and cytogenetic analyses of the Physalaemus cuvieri-Physalaemus ephippifer species complex (Anura, Leptodactylidae). 2020. 1 recurso online ( 66 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP.
Date Issue: 2020
Appears in Collections:IB - Tese e Dissertação

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