Please use this identifier to cite or link to this item: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/352908
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.CRUESPUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASpt_BR
dc.contributor.authorunicamp.Rojas, Thaís Cabrera Galvão-
dc.contributor.authorunicampMaluta, Renato Pariz-
dc.contributor.authorunicampDias da Silveira, Wanderley-
dc.typeArtigopt_BR
dc.titleIn silico phylogenetic and virulence gene profile analyses of avian pathogenic Escherichia coli genome sequencespt_BR
dc.title.alternativeAnálises in silico da filogenia e do perfil de genes associados à virulência, dos genomas de linhagens de Escherichia coli de origem aviáriapt_BR
dc.contributor.authorRojas, Thaís C.G.-
dc.contributor.authorMaluta, Renato P.-
dc.contributor.authorKoenigkan, Luciano V.-
dc.contributor.authorSilveira, Wanderley Dias da-
dc.subjectEscherichia coli patogenica aviariapt_BR
dc.subject.otherlanguageAvian pathogenic Escherichia colipt_BR
dc.description.abstractAvian pathogenic Escherichia coli (APEC) infections are responsible for significant losses in the poultry industry worldwide. A zoonotic risk has been attributed to APEC strains because they present similarities to extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) associated with illness in humans, mainly urinary tract infections and neonatal meningitis. Here, we present in silico analyses with pathogenic E. coli genome sequences, including recently available APEC genomes. The phylogenetic tree, based on multi-locus sequence typing (MLST) of seven housekeeping genes, revealed high diversity in the allelic composition. Nevertheless, despite this diversity, the phylogenetic tree was able to cluster the different pathotypes together. An in silico virulence gene profile was also determined for each of these strains, through the presence or absence of 83 well-known virulence genes/traits described in pathogenic E. coli strains. The MLST phylogeny and the virulence gene profiles demonstrated a certain genetic similarity between Brazilian APEC strains, APEC isolated in the United States, UPEC (uropathogenic E. coli) and diarrheagenic strains isolated from humans. This correlation corroborates and reinforces the zoonotic potential hypothesis proposed to APECpt_BR
dc.relation.ispartofPesquisa veterinaria brasileirapt_BR
dc.relation.ispartofabbreviationPesqui. vet. bras.pt_BR
dc.publisher.cityRio de Janeiro, RJpt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisherColégio Brasileiro de Patologia Animalpt_BR
dc.date.issued2014-
dc.date.monthofcirculationFeb.pt_BR
dc.language.isoengpt_BR
dc.description.volume34pt_BR
dc.description.issuenumber2pt_BR
dc.description.firstpage129pt_BR
dc.description.lastpage133pt_BR
dc.rightsAbertopt_BR
dc.sourceSCOPUSpt_BR
dc.identifier.issn0100-736Xpt_BR
dc.identifier.eissn1678-5150pt_BR
dc.identifier.doi10.1590/S0100-736X2014000200006pt_BR
dc.identifier.urlhttps://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-736X2014000200006pt_BR
dc.description.sponsorshipCOORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR - CAPESpt_BR
dc.description.sponsorshipFUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESPpt_BR
dc.description.sponsorshipCONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQpt_BR
dc.description.sponsordocumentnumbersem informaçãopt_BR
dc.description.sponsordocumentnumber23038.042588/2008-11pt_BR
dc.description.sponsordocumentnumber2010/51421-8; 2012/04931- 6; 2012/05073-3pt_BR
dc.date.available2020-12-02T21:01:26Z-
dc.date.accessioned2020-12-02T21:01:26Z-
dc.description.provenanceSubmitted by Sanches Olivia (olivias@unicamp.br) on 2020-12-02T21:01:26Z No. of bitstreams: 0. Added 1 bitstream(s) on 2021-02-25T19:55:27Z : No. of bitstreams: 1 2-s2.0-84901235800.pdf: 456037 bytes, checksum: 74c2e24fb85fb2ac0bdcc4d307eb2ab6 (MD5)en
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2020-12-02T21:01:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014en
dc.identifier.urihttp://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/352908-
dc.contributor.departmentsem informaçãopt_BR
dc.contributor.departmentsem informaçãopt_BR
dc.contributor.departmentDepartamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologiapt_BR
dc.contributor.unidadeInstituto de Biologiapt_BR
dc.description.abstractalternativeAs infecções causadas por linhagens de Escherichia coli de origem aviária (APEC) são responsáveis por perdas significativas na indústria avícola em todo mundo. Risco zoonótico tem sido atribuído às linhagens APEC, devido às semelhanças existentes entre elas e linhagens de E. coli patogênicas extraintestinais (ExPEC) de origem humana, causadoras de infecções no trato urinário e meningite neonatal. Neste trabalho, apresentamos os resultados de análises in silico feitas a partir dos genomas de linhagens patogênicas de E. coli, incluindo genomas recentemente obtidos de linhagens APEC. Uma árvore filogenética foi obtida, com base na tipagem de sequência multilocus (MLST) de sete genes essenciais, revelando alta diversidade na composição de alelos, mas ainda assim possibilitando o agrupamento dos diferentes patótipos. Foi determinado também, para cada linhagem, o perfil gênico, por meio da presença ou ausência de 83 genes associados à virulência. A árvore filogenética e o perfil gênico demonstraram que existem semelhanças genéticas entre cepas APEC brasileiras, APEC isolada nos Estados Unidos, UPEC (uropathogenic E. coli) e linhagens produtoras de diarreia em humanos. Essa correlação corrobora e reforça a hipótese de que linhagens APEC apresentam potencial risco zoonóticopt_BR
dc.subject.keywordMulti-locus Sequence Typing (MLST)pt_BR
dc.subject.keywordPhylogenetic treept_BR
dc.subject.keywordVirulence genespt_BR
dc.identifier.source2-s2.0-84901235800pt_BR
dc.creator.orcidsem informaçãopt_BR
dc.creator.orcid0000-0003-3249-5127pt_BR
dc.creator.orcid0000-0003-3550-0745pt_BR
dc.type.formArtigopt_BR
Appears in Collections:IB - Artigos e Outros Documentos

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
2-s2.0-84901235800.pdf445.35 kBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.