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Type: DISSERTAÇÃO DIGITAL
Degree Level: Mestrado
Title: Dinâmica molecular de uma nova família de Glicosil Hidrolases (GH-X)
Title Alternative: Molecular dynamics simultions of a new family of Glycoside Hidrolases (GH-X)
Author: Tormet Gonzalez, Sinkler Eduardo, 1990-
Advisor: Skaf, Munir Salomão, 1963-
Abstract: Resumo: As glicosil hidrolases (GH) são enzimas que exercem um papel importante na hidrólise de ligações glicosídicas de açúcares complexos como celulose, hemicelulose e amido, constituindo uma das famílias enzimáticas de maior importância na degradação destes polissacarídeos. Este processo de degradação é de particular interesse devido à sua associação com a produção de bioetanol a partir de bagaço de cana de açúcar e de biomassa lignocelulósica em geral. Assim, a caracterização funcional e estrutural das GHs é de grande valor para aplicações industriais. Com intuito de conhecer a dinâmica destas proteínas, o que não pode ser facilmente determinado por meios experimentais, empregamos neste estudo metodologias de dinâmica molecular (DM) para determinar as propriedades estruturais e dinâmicas básicas de duas enzimas representativas de uma nova família de GHs, aqui denominada GH-X. Os analises feitos mostram os principais fenômenos dinâmicos e estruturais assim como as principais interações enzima-substrato e sua relação com a eficiência catalítica desta nova família GH-X

Abstract: Glycoside Hydrolases (GH) are enzymes that play important roles in the hydrolysis of glycosidic bonds during the degradation of lignocellulosic biomass. The structural characterization of these enzymes is considered highly valuable for the second-generation ethanol production due to their central role on cellulose and hemicellulose saccharification. The use of molecular dynamics techniques to study conformational changes, substrate binding and the properties of the substrate itself has been essential to enlighten the molecular mechanisms involved on the enzymatic activity that cannot be easily studied through experimental methodologies. In this work, we used molecular dynamics techniques to study two representative proteins of a new family of glycoside hydrolases (GH-X). From our analysis, we provide strong suggestions about the key interactions and structure-dynamics relationships underlying the differences experimentally observed on their catalytic efficiency
Subject: Glicosídeo hidrolases
Dinâmica molecular
Etanol 2G
Enzimas
Language: Português
Editor: [s.n.]
Citation: TORMET GONZALEZ, Sinkler Eduardo. Dinâmica molecular de uma nova família de Glicosil Hidrolases (GH-X) . 2019. 1 recurso online ( 91 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP.
Date Issue: 2019
Appears in Collections:IQ - Tese e Dissertação

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