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Type: TESE DIGITAL
Degree Level: Doutorado
Title: RNA interferente no estudo e controle de fungos patogênicos de citros = RNA interference in the study and control of citrus phytopathogenic fungi
Title Alternative: RNA interference in the study and control of citrus phytopathogenic fungi
Author: Goulin, Eduardo Henrique, 1986-
Advisor: Machado, Marcos Antonio
Abstract: Resumo: Desde a antiguidade a cultura dos citros é economicamente importante para vários países ao redor do mundo. O Brasil é um dos maiores produtores e exportadores de citros e seus derivados, tendo em sua região Sudeste a maior concentração de pomares. Muitos fitopatógenos são responsáveis por significativas perdas na produção citrícola e na qualidade dos frutos. Dentre as doenças causadas por fungos a podridão floral é caracterizada por lesões nas pétalas podendo acometer os frutos em formação provocando sua queda prematura. Um dos agentes causais pertencente ao complexo de espécies Colletotrichum acutatum é o Colletotrichum abscissum. O controle dessa doença é baseado na utilização de fungicidas que agem interrompendo a respiração celular do patógeno. Da mesma forma, esse é o alvo para controle de outra importante doença que acomete os citros, a mancha preta, cujo agente causal é o fungo Phyllosticta citricarpa. Porém, são comuns descrições de resistência dos patógenos associada à controladores químicos. Novas tecnologias vêm sendo desenvolvidas para controlar fitopatógenos, dentre elas as baseadas em RNA interferente (RNAi). A fim de melhor entender os processos e indicar possíveis estratégias de controle de podridão floral. Inicialmente, realizou-se a caracterização filogenética do isolado C. abscissum. Em seguida, o genoma desse isolado foi sequenciado, montado e anotado. Com isso, foi possível a busca por genes de proteínas da maquinaria de silenciamento gênico, indicando a presença desse mecanismo nesse fungo, além de possíveis alvos para controle via RNAi. Valendo-se dessas informações, comprovou-se o funcionamento dessa maquinaria utilizando silenciamento de proteína repórter. Posteriormente, após certificar-se que a técnica é funcional, foram silenciados genes endógenos de subunidades de proteínas envolvidas na respiração celular, que são usualmente alvos de fungicidas químicos, indicando a perspectiva do uso de estratégias baseadas em RNAi para controle da podridão floral, o que diminui a probabilidade de aparecimento de resistência, comumente associada a uma mutação de ponto. Um método eficiente e confiável de indução de sintoma in vitro de podridão floral foi desenvolvido para avaliação de alterações de patogenicidade em mutantes de C. abscissum

Abstract: Since ancient times citrus is an economically important culture for many countries worldwide. Brazil is one of the largest producer and exporter of citrus and its derives, with most of orchards concentrated in the Southeast region of the country. Many phytopathogens are responsible for significant losses in citrus production and fruit quality. Postbloom fruit drop is one of the many fungal diseases that can attack the citrus crop. The disease is characterized by lesions on the petals that can extend to young fruits, inducing their early drop. One of the causal agents of this disease is Colletotrichum abscissum, which belongs to the Colletotrichum acutatum species complex. The disease control is based on chemical fungicides that block the fungus cell respiration. This form of control is also used to target cell respiration of another fungus, Phyllosticta citricarpa, causal agent of a different citrus disease, the citrus black spot. Since pathogen resistance for those chemical agents are frequently reported, new technologies are being developed to control this phytopathogens. One of these technologies is the RNA interference. In other to better understand the process and indicate strategies to control the postbloom fruit drop, the correct phylogenetic classification of an isolate of C. abscissum was made. Then, the whole genome sequencing and assembly of this fungus was performed. Therewith, genes of proteins related to the RNAi machinery were found, indicating the presence of this mechanism in C. abscissum, and also possible target genes for control by RNAi. Using these information, the functionality of the RNAi machinery was evaluated by effectively silencing of a reporter protein. Thereafter, endogenous genes that encode the subunits of enzymes related to cell respiration, which are targets of chemical fungicides, were silenced by RNAi indicating a perspective for the use of this strategy for postbloom fruit drop control, decreasing the chances of resistance, commonly associated to a single-point mutation. To evaluate the C. abscissum mutant pathogenicity alterations, an efficient and reliable in vitro symptom induction system was developed
Subject: Interferência de RNA
Fungos fitopatogenicos
Fungicidas
Colletotrichum
Cítricos
Language: Português
Editor: [s.n.]
Citation: GOULIN, Eduardo Henrique. RNA interferente no estudo e controle de fungos patogênicos de citros = RNA interference in the study and control of citrus phytopathogenic fungi. 2017. 1 recurso online (141 p.). Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.repositorio.unicamp.br/handle/REPOSIP/331495>. Acesso em: 3 set. 2018.
Date Issue: 2017
Appears in Collections:IB - Tese e Dissertação

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