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dc.contributor.CRUESPUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASpt_BR
dc.descriptionOrientador: Andrea Balan Fernandespt_BR
dc.descriptionTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologiapt_BR
dc.format.extent1 recurso online (120 p.) : il., digital, arquivo PDF.pt_BR
dc.format.mimetypeapplication/pdfpt_BR
dc.languageMultilínguapt_BR
dc.relation.requiresRequisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDFpt_BR
dc.typeTESE DIGITALpt_BR
dc.titleEstudos funcionais e estruturais sobre o transportador do tipo ABC de sulfato em "Xanthomonas citri" = Functional and Structural analysis about sulfate ABC transporter in "Xanthomonas citri"pt_BR
dc.title.alternativeFunctional and Structural analysis about sulfate ABC transporter in "Xanthomonas citri"pt_BR
dc.contributor.authorPereira, Cristiane Tambascia, 1983-pt_BR
dc.contributor.advisorBalan, Andreapt_BR
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologiapt_BR
dc.contributor.nameofprogramPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecularpt_BR
dc.subjectXanthomonas citri subsp. citript_BR
dc.subjectCancro citricopt_BR
dc.subjectTransportadores de cassetes de ligação de ATPpt_BR
dc.subjectSulfatospt_BR
dc.subjectRegulonpt_BR
dc.subject.otherlanguageXanthomonas citri subsp. citrien
dc.subject.otherlanguageCitrus cankeren
dc.subject.otherlanguageATP-binding cassette transportesen
dc.subject.otherlanguageSulfatesen
dc.subject.otherlanguageRegulonen
dc.description.abstractResumo: Xanthomonas citri sp. citri (X.citri) é um fitopatógeno causador do cancro cítrico. Esta doença causa importantes perdas para economia brasileira já que o país é um dos maiores exportadores do suco de laranja e não há uma forma efetiva de controle dessa doença. Em X. citri, pouco se conhece sobre a captação de íons, incluindo sulfato, elemento essencial para o crescimento celular em todas as formas de vida. Em estudos prévios, foi mostrado que o transportador de alta afinidade do tipo ABC de sulfato e a via de assimilação do mesmo estão completos em X. citri e que são ativados durante o crescimento in vitro e in vivo. Com a finalidade de continuar esses estudos, este trabalho propôs a caracterização funcional e estrutural do transportador ABC de sulfato SbpCysUWA. A análise estrutural foi limitada à proteína periplasmática Sbp, uma vez que as permeases e ATPase não foram expressas mesmo após inúmeras tentativas. O domínio periplasmático Sbp, teve sua estrutura resolvida a 1.14 Å na presença do íon, o que permitiu a caracterização do bolsão de ligação e seus resíduos e análises biofísicas determinaram sua afinidade ao íon. Por outro lado, os estudos funcionais realizados com um mutante de X. citri portador de deleção do gene cysU (que codifica uma das permeases) e bloqueia o poro de entrada do sulfato mostraram que houve diminuição na produção de goma xantana e xantomonadina, não houve interferência no crescimento bacteriano in vitro e nem na formação do biofilme. Adicionalmente, infecções de folhas de cinco variedades de citros mostraram que a deleção afeta o período de infecção, mas não o fenótipo do cancro. Estes dados sugerem que outros transportadores do tipo ABC, de alta afinidade, como os de alcanosulfonados Ssu(1) e Ssu(2), caracterizados pelo grupo neste período, poderiam complementar a carência do enxofre, mas não a captação de sulfato. Adicionalmente, foram identificadas e caracterizadas três proteínas de X. citri com função putativa de carreadores de íons, mas de baixa afinidade. Com ensaios de RT-PCR mostramos que os genes de todos estes transportadores são transcritos em meio XAM1 (o qual mimetiza as condições de infecção) e a proteína putativa de captação e regulação de sulfato, Sac1 não é expressa em meio rico LB ON. Estes dados mostram que a bactéria possui e utiliza de todos os seus recursos para manter os níveis de enxofre durante o seu crescimento. Finalmente, este trabalho abriu uma série de perspectivas para futuros estudos sobre estes transportadores, tanto do ponto de vista funcional como estrutural para melhor compreensão da regulação da importação de íons no fitopatógenopt
dc.description.abstractAbstract: Xanthomonas citri sp. citri is a phytopathogenic bacteria causes citrus canker in citrus. This disease causes important economic losses for Brazil because this country is on of most exporter for orange juice and no have effective control disease. In. X. citri has lack information about ion uptake in general, include sulfate, essential element for grown in all types of life. Previous studies described the high affinity sulfate ABC transporter and this assimilation pathway is complete in X. citri and activated during grown in vitro and in vivo. To continue this studies, this work was proposed to characterize, functional, and structural insights for ABC Transporter SbpCysUWA. The periplasmic compound was solved at 1.14 Å with sulfate into the pocket .allowing to understand the ligation coordination. On the other hand, functional studies with knockout for Cys U permease reduces gum xanthan production and xanthomonadin but not the ability to grown culture in vitro. In addition, leaf infections of five different citrus varieties presented by a deletion, affect the infection period but not the cancer phenotype. These data other high affinity ABC transporters, such as the Ssu (1) and Ssu (2) alkanesulfonates, characterized by the group in the Sulphur starvation in this period. Moreover, were identified three putative sulfate carrier with low ion affinity. RT-PCR data showed this genes is transcripts in LB ON (expects sac1 gene) and inducing media XAM1( in vitro). These data show that the bacteria uses all its resources to maintain sulfur levels during its growth. Finally, this work has opened a series of perspectives for future studies on these transporters, both from a functional and structural insightsen
dc.publisher[s.n.]pt_BR
dc.date.issued2017pt_BR
dc.identifier.citationPEREIRA, Cristiane Tambascia. Estudos funcionais e estruturais sobre o transportador do tipo ABC de sulfato em "Xanthomonas citri" = Functional and Structural analysis about sulfate ABC transporter in "Xanthomonas citri". 2017. 1 recurso online (120 p.). Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.repositorio.unicamp.br/handle/REPOSIP/331411>. Acesso em: 3 set. 2018.pt_BR
dc.description.degreelevelDoutoradopt_BR
dc.description.degreedisciplineGenetica de Microorganismospt_BR
dc.description.degreenameDoutora em Genética e Biologia Molecularpt_BR
dc.contributor.committeepersonalnameSouza, Alessandra Alves dept_BR
dc.contributor.committeepersonalnameKobarg, Jörgpt_BR
dc.contributor.committeepersonalnameSoprano, Adriana Santospt_BR
dc.contributor.committeepersonalnameFerreira, Rita de Cássia Cafépt_BR
dc.date.defense2017-12-12T00:00:00Zpt_BR
dc.description.sponsordocumentnumber2013/16094-4 , 2015/26203-0pt_BR
dc.date.available2018-09-03T13:29:35Z-
dc.date.accessioned2018-09-03T13:29:35Z-
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2018-09-03T13:29:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pereira_CristianeTambascia_D.pdf: 15226122 bytes, checksum: ccc4a308ca986df308671eb20f8f842e (MD5) Previous issue date: 2017en
dc.identifier.urihttp://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/331411-
dc.description.sponsorFAPESPpt_BR
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