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dc.contributor.CRUESPUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASpt_BR
dc.descriptionOrientadores: Anete Pereira de Souza, Lívia Moura de Souzapt_BR
dc.descriptionTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologiapt_BR
dc.format.extent1 recurso online (104 p.) : il., digital, arquivo PDF.pt_BR
dc.format.mimetypeapplication/pdfpt_BR
dc.relation.requiresRequisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDFpt_BR
dc.typeTESE DIGITALpt_BR
dc.titleMapeamento genético-molecular e análise de QTLs associados ao crescimento em Hevea brasiliensis utlizando marcadores microssatélites e SNPs = Genetic mapping and QTL analysis of growth-related traits in Hevea brasiliensis using microsatellite and SNP markerspt_BR
dc.title.alternativeGenetic mapping and QTL analysis of growth-related traits in Hevea brasiliensis using microsatellite and SNP markerspt_BR
dc.contributor.authorConson, André Ricardo Oliveira, 1987-pt_BR
dc.contributor.advisorSouza, Anete Pereira de, 1962-pt_BR
dc.contributor.coadvisorSouza, Livia Moura de, 1980-pt_BR
dc.contributor.institutionUniversidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologiapt_BR
dc.contributor.nameofprogramPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecularpt_BR
dc.subjectSeringueirapt_BR
dc.subjectHeveapt_BR
dc.subjectMapeamento cromossômicopt_BR
dc.subjectMapeamento de QTLpt_BR
dc.subjectMarcadores molecularespt_BR
dc.subject.otherlanguageRubber plantsen
dc.subject.otherlanguageHeveaen
dc.subject.otherlanguageChromosome mappingen
dc.subject.otherlanguageQTL analysisen
dc.subject.otherlanguageMolecular markersen
dc.description.abstractResumo: O aspecto emblemático que a seringueira sugere quando se trata de produção de borracha natural no Brasil, é limitado atualmente devido, principalmente, a ausência de clones resistentes a doença chamada mal-das-folhas, causada pelo fungo Microcyclus ulei. Clones adaptados a "áreas de escape", onde níveis epidêmicos da doença não são observados, podem ser uma alternativa para contornar problemas relacionados às condições climáticas desfavoráveis ao crescimento e produção de látex. O uso de ferramentas da biologia molecular pode ajudar na identificação de locos que controlam características quantitativas (QTLs), sobretudo a partir do desenvolvimento das tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS). Foi desenvolvido na presente tese um mapa genético para uma população F1 segregante (GT1 e RRIM701), onde medidas fenotípicas de diâmetro foram obtidas em diferentes idades de crescimento (12 meses, 17 meses, 22 meses, 28 meses e 35 meses), para a detecção de QTLs relacionados ao crescimento e vigor das plantas. A partir da abordagem de genotipagem por sequenciamento (GBS), foi possível selecionar 2.998 SNPs utilizando diferentes parâmetros de filtragem. Um total de 1.082 marcadores SSRs e SNPs foram mapeados, sendo 671 SNPs oriundos de GBS. Os marcadores foram distribuídos em 18 grupos de ligação e cobriram um total de 3.779,7 cM, com uma densidade de 1 marcador a cada 3,49 cM. A genotipagem de marcadores SNP através da técnica de GBS contribuiu para o aumento da densidade de marcadores, em especial em regiões onde se observava uma quantidade reduzida de marcadores SSRs. Foram detectados 19 QTLs relacionados ao diâmetro de caule em cinco épocas de crescimento avaliadas durante as estações de verão e inverno. Também foi possível observar efeitos aditivos e de dominância dos QTLs com diversos padrões de segregação auxiliando no maior entendimento da arquitetura genética de caracteres quantitativos, possibilitando novo direcionamento para o melhoramento genético da seringueirapt
dc.description.abstractAbstract: The symbolic aspect that rubber tree suggests by the natural rubber production in Brazil is currently limited, mainly due the lack of resistant clones to the South America Leaf Blight disease, caused by the fungus Microcyclus ulei. Clones adapted to the so-called "escape regions", where epidemic levels of disease is not observed, may be an alternative to overcome problems related to unfavorable climatic conditions for growth and latex production. Molecular biology tools usage can help to identify loci controlling quantitative traits (QTL), especially with the development of next generation sequencing technologies. It was developed in this thesis a genetic map for a full-sib population (GT1 and RRIM701) with phenotypic measures for diameter made at different growth ages (12 months, 17 months, 22 months, 28 months and 35 months) to detect QTL related to plant-growth and vigor. From the genotyping by sequencing approach (GBS), it was possible to detect 2,998 SNPs using different filtering parameters. A total of 1,082 SSR and SNP markers were mapped, with 671 SNPs from GBS. The markers were distributed into 18 linkage groups and covered a total of 3,779.7 cM with a marker density of 3.49 cM. SNP genotyping using the GBS contributed to increase marker density, especially in regions where it was observed a reduced quantity of SSR markers. We detected 19 QTL related to stem diameter at five growth periods evaluated during summer and winter seasons. It was also observed additive and dominance effects for QTL with different patterns of segregation that helps better understand the genetic architecture of quantitative traits, thus enabling new directions to genetic breeding of rubber treeen
dc.publisher[s.n.]pt_BR
dc.date.issued2016pt_BR
dc.identifier.citationCONSON, André Ricardo Oliveira. Mapeamento genético-molecular e análise de QTLs associados ao crescimento em Hevea brasiliensis utlizando marcadores microssatélites e SNPs = Genetic mapping and QTL analysis of growth-related traits in Hevea brasiliensis using microsatellite and SNP markers. 2016. 1 recurso online (104 p.). Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.repositorio.unicamp.br/handle/REPOSIP/331179>. Acesso em: 1 set. 2018.pt_BR
dc.description.degreelevelDoutoradopt_BR
dc.description.degreedisciplineGenetica Vegetal e Melhoramentopt_BR
dc.description.degreenameDoutor em Genetica e Biologia Molecularpt_BR
dc.contributor.committeepersonalnameMargarido, Gabriel Rodrigues Alvespt_BR
dc.contributor.committeepersonalnameMaluf, Mirian Perezpt_BR
dc.contributor.committeepersonalnameRibeiro, Rafael Vasconcelospt_BR
dc.contributor.committeepersonalnameBrandão, Marcelo Mendespt_BR
dc.date.defense2016-12-05T00:00:00Zpt_BR
dc.description.sponsordocumentnumber2007/50562-4, 2012/50491-8pt_BR
dc.description.sponsordocumentnumber562979/2010-7, 478701/2012-8, 162629/2015-0pt_BR
dc.date.available2018-09-01T08:28:53Z-
dc.date.accessioned2018-09-01T08:28:53Z-
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2018-09-01T08:28:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Conson_AndreRicardoOliveira_D.pdf: 7510607 bytes, checksum: f94d6e5942d8396b2987e269703ad081 (MD5) Previous issue date: 2016en
dc.identifier.urihttp://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/331179-
dc.description.sponsorFAPESPpt_BR
dc.description.sponsorCNPQpt_BR
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