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Type: DISSERTAÇÃO DIGITAL
Degree Level: Mestrado
Title: Construção de um mapa genético molecular para Hevea brasiliensis = Construction of a genetic linkage map in Hevea brasiliensis
Title Alternative: Construction of a genetic linkage map in Hevea brasiliensis
Author: Andreotti, Isabela Aparecida de Araujo, 1992-
Advisor: Souza, Anete Pereira de, 1962-
Abstract: Resumo: A seringueira [Hevea brasiliensis (Willd. ex. A. Juss.) Muell. Arg.], planta nativa da região Amazônica, é a maior fonte de borracha natural do mundo. Apesar de a região amazônica oferecer ótimas condições climáticas para o cultivo da seringueira, esta é a área de ocorrência do fungo Microcyclus ulei. Deste modo, a heveicultura se expandiu para áreas de escape como, por exemplo, a região sudeste do Brasil. Entretanto, estas novas áreas propiciam novas condições de estresse, limitando o seu crescimento e a produção de látex. O melhoramento genético vem buscando clones adaptados a essas novas áreas de escape, contudo como o ciclo de melhoramento da seringueira pode demorar aproximadamente 30 anos para concretizar-se, tem-se a necessidade do desenvolvimento de novas técnicas de avaliação precoce, que possibilitem diminuir e otimizar as avaliações para a cultura. Neste contexto, o presente trabalho apresenta o primeiro mapa genético para uma população F1 segregante derivada do cruzamento entre os clones GT1, que apresenta tolerância ao vento e ao frio, e RRIM701, que possui produtividade de média a alta. Para a construção do mapa foram desenvolvidos 143 marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), a partir de dados de sequenciamento genômico, dos quais 29 (12,9%) apresentaram-se polimórficos para a população de mapeamento. Também foram genotipados outros marcadores SNPs e microssatélites, já descritos na literatura. O mapa genético contém 337 marcadores, dos quais 100 foram genotipados neste trabalho. O software OneMap foi utilizado para a construção do mapa que possui 2.250,7 cM de extensão e 19 grupos de ligação. Os marcadores SNPs desenvolvidos neste trabalho são ferramentas extremamente úteis ao melhoramento genético para seleção assistida por marcadores e seleção genômica, além de enriquecer a construção de outros mapas genéticos. O mapa genético desenvolvido representa um avanço para o melhoramento genético de seringueira por ser uma ferramenta que auxilia a identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci) relacionados a caracteres de importância econômica com maior precisão e, também por permitir uma melhor compreensão da arquitetura genética da espécie

Abstract: The rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. Ex. A. Juss.) Muell. Arg.], a native plant of the Amazon region, is the greatest source of natural rubber in the world. Although the Amazon region provides optimal climatic conditions for the cultivation of the rubber tree, this is the area of occurrence of fungus Microcyclus ulei. Thus, the rubber cultivation has expanded to escape areas such as the southeastern region of Brazil. However, these new areas propitiate new stress conditions, limiting the trees growth and latex production. Genetic breeding is seeking clones tailored for these escape new areas, but as the rubber tree breeding cycle may take approximately 30 years to materialize, it has become necessary to develop precocious evaluation techniques, which may reduce and optimize crops assessments. In this context, this work presents the first genetic map for a F1 segregating population derived from a cross between the clones GT1, wind and cold tolerant, and RRIM701, which presents high productivity. For the construction of the map, we developed 143 SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) markers, from genomic sequencing data, of which 29 displayed polymorphism for the mapping population. We also genotyped other SNPs and microsatellite markers, previously described in the literature. The genetic map contains 337 markers, of which 100 were genotyped in this work. The software OneMap was used to construct the map that has 2250.7 cM in length and 19 linkage groups. The SNP markers developed in this work are extremely useful tools for genetic improvement through marker-assisted selection and genomic selection, in addition to enriching the construction of other genetic maps. The genetic map developed represents an advance for the genetic improvement of the rubber tree, for being an important tool that helps identifying with greater precision QTL (Quantitative Trait Loci) related to traits of economic importance and also to allow a better understanding of genetics architecture of the species
Subject: Mapeamento cromossômico
Seringueira
Polimorfismo de nucleotídeo único
Microssatélites (Genética)
Editor: [s.n.]
Citation: ANDREOTTI, Isabela Aparecida de Araujo. Construção de um mapa genético molecular para Hevea brasiliensis = Construction of a genetic linkage map in Hevea brasiliensis. 2016. 1 recurso online (80 p.). Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.repositorio.unicamp.br/handle/REPOSIP/325732>. Acesso em: 31 ago. 2018.
Date Issue: 2016
Appears in Collections:IB - Tese e Dissertação

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