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Type: TESE DIGITAL
Title: Perfil fenotípico e genotípico da resistência aos antimicrobianos em "Klebsiella pneumoniae", "Salmonella enterica" e estafilococos coagulase-negativa
Title Alternative: Phenotypic and genotypic profile of antimicrobial resistance in "Klebsiella pneumoniae", "Salmonella enterica" and coagulase-negative Staphylococcus
Author: Nóbrega, Diego Borin, 1984-
Advisor: Brocchi, Marcelo, 1967-
Abstract: Resumo: A resistência antimicrobiana é um problema comumente encontrado em medicina humana e veterinária. Agentes como "Klebsiella pneumoniae", "Salmonella enterica" e estafilococos coagulase-negativa (ECN) são alvo de pesquisas na detecção e identificação de genes de resistência aos antimicrobianos. O presente estudo visou estabelecer o perfil de resistência fenotípico e genotípico em: (i) amostras de S. enterica isoladas de animais domésticos e pacientes humanos no Estado de São Paulo; (ii) amostras de K. pneumoniae isoladas de fezes e leite de bovinos leiteiros em rebanhos Brasileiros; e (iii) amostras de ECN isoladas de leite bovino de rebanhos leiteiros Canadenses. Ainda, estudar associações entre os respectivos perfis e a origem dos isolados, os diferentes sistemas de produção, os estratos de células somáticas do tanque, e estabelecer associações entre a utilização de antimicrobianos e resistência aos mesmos em isolados de ECN. Neste projeto, 166 isolados de K. pneumoniae oriundos de 24 propriedades leiteiras, 153 S. enterica oriundos de carcaças de frangos de corte e pacientes humanos e 1.859 amostras de ECN isoladas de leite de vacas em rebanhos Canadenses foram submetidos ao antibiograma e à detecção molecular de genes de resistência, associados ao respectivo perfil. Ainda, foram obtidas associações dos perfis de resistência com a origem dos isolados. No caso de S. enterica, resistência foi comumente observada para estreptomicina, tetraciclina, combinação de sulfametoxazol / trimetoprim e amoxicilina. Os genes mais comumente encontrados de acordo com estes perfis foram aadA, tetC, sul1 e blactx-m, sendo este, para nosso conhecimento, o primeiro relato do gene qnrB em S. enterica isolada de humanos no Brasil. Os perfis observados foram distintos em isolados humanos e animais corroborando com estudos prévios que demonstram diferentes mecanismos de resistência em medicina humana e veterinária, com o primeiro demonstrando maiores proporções de resistência para diversas drogas. Nos isolados de K. pneumoniae, foi detectada uma associação entre a origem do isolado (leite ou fezes) e a resistência para estreptomicina, cloranfenicol, tetraciclina e sulfametoxazol. Perfis multirresistentes foram observados apenas em isolados de origem clínica (leite mastítico). Os genes comumente encontrados incluíram tetD, tetB e sul2. Tratando-se de isolados de ECN, resistência às sulfonamidas foi o perfil mais comumente observado (18,65%) seguido pela penicilina, tetraciclina e eritromicina (11,95%, 11,29% e 6,5% respectivamente). Entre as Províncias Canadenses, Alberta apresentou a menor prevalência de resistência às sulfonamidas, apesar de a prevalência de isolados multirresistentes ter sido constante nas diferentes Províncias. Nos diferentes tipos de instalações, isolados de tie-stalls tiveram maior chance de serem multirresistentes em comparação com isolados de free-stall. A utilização de antimicrobianos foi associada à presença de isolados multirresistentes, especialmente no caso do cloranfenicol e macrolídeos. Os genes blaZ e mecA (beta-lactâmicos), str e aadE (aminoglicosídeos), ermA e ermC (macrolídeos), tetK e tetL (tetraciclinas) foram os mais comumente observados

Abstract: Antimicrobial resistance is a major concern in both human and veterinary medicine. Agents such as "Klebsiella pneumoniae", "Salmonella" enterica and coagulase-negative Staphylococcus (CNS) are subject of researches involving detection and identification of antimicrobial resistance genes. The present study aimed to establish the phenotypic and genotypic resistance profile in: (i) S. enterica isolated from domestic animals and human patients from São Paulo State; (ii) K. pneumoniae isolated from bovine feces and milk in Brazilian dairy herds and; (iii) CNS samples isolated from lactating cows in Canadian dairy herds. Still, study associations between resistance profiles and different sources, barn types, bulk tank somatic cell count and to establish associations between antimicrobial usage and resistance in CNS. In this project, 166 K. pneumoniae isolates from 24 dairy farms, 153 S. enterica isolates originating from broiler carcasses and human patients and 1,859 CNS isolates from Canadian dairy herds were subjected to antimicrobial susceptibility tests and molecular detection of resistance genes according to the respective phenotypic profile. Still, associations between resistance profile and the origin of the isolates were determined. For S. enterica, non-susceptibility was commonly observed for streptomycin, tetracycline, sulfamethoxazole and amoxicillin. Genes commonly observed according to the distinct profiles were aadA, tetC, sul1 and blactx-m according to the respective profile. For our knowledge, this is the first report of the presence of qnrB gene in S. enterica isolated from human patients in Brazil. Profiles were distinct for human and animal isolates, with the first showing a higher proportion of non-susceptibility for several drugs. For K. pneumoniae isolates, it was observed an association between the source (milk; feces) and non-susceptibility for streptomycin, chloramphenicol, tetracycline and sulfamethoxazole. Multidrug resistance (MDR) was observed only for clinical mastitis isolates. Genes commonly observed included tetD, tetB and sul2. For CNS isolates, non-susceptibility to sulfonamides was the most commonly observed (18.65%) followed by penicillin, tetracycline and erythromycin (11.95, 11.29 and 6.5% of isolates tested, respectively). Alberta showed the lowest prevalence of sulfonamides non-susceptibility, although the prevalence of MDR isolates was constant across different Provinces. Samples from tie-stalls had higher odds of being MDR than samples from free-stalls. Antimicrobial usage was associated with the presence of MDR, especially for chloramphenicol and macrolides. blaZ and mecA (beta-lactams), str and aadE (aminoglycosides), ermA and ermC (macrolides), tetK and tetL (tetracyclines) genes were the most commonly observed
Subject: Testes de sensibilidade bacteriana
Antibióticos beta-lactamicos
Genes
Klebsiella pneumoniae
Resistência beta-lactâmica
Editor: [s.n.]
Date Issue: 2016
Appears in Collections:IB - Dissertação e Tese

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