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Type: TESE DIGITAL
Degree Level: Doutorado
Title: Saturação do mapa genético molecular de Urochloa humidicola = Saturation of molecular genetic map in Urochloa humidicola
Title Alternative: Saturation of molecular genetic map in Urochloa humidicola
Author: Santos, Jean Carlos de Souza, 1986-
Advisor: Souza, Anete Pereira de, 1962-
Abstract: Resumo: Extensas áreas do Brasil são destinadas ao cultivo de pastagens, cuja finalidade é a alimentação bovina. Estas áreas são ocupadas por diversas espécies forrageiras, incluindo as pertencentes ao gênero Urochloa, formado por algumas das espécies mais plantadas no país, como a U. humidicola. Esta espécie é um hexaploide que se reproduz por meio de apomixia, sendo originária da África; como principais características apresenta tolerância a áreas úmidas e solos ácidos e capacidade de resistir bem ao pastejo pesado. Há poucas décadas, a Embrapa iniciou um programa de melhoramento em Urochloa, no qual diversos cruzamentos já foram realizados em várias espécies do gênero, inclusive em U. humidicola: a cultivar comercial BRS Tupi foi cruzada com o acesso H031, único genótipo sexual presente no Banco de Germoplasma (BAG) da Embrapa, gerando uma população de 364 genótipos, dos quais 279 indivíduos foram identificados como sendo híbridos F1. Estes híbridos foram utilizados na construção de um mapa genético obtido por meio de marcadores microssatélites, desenvolvidos exclusivamente para a espécie. No entanto, devido à pouca saturação do mapa, neste trabalho novos marcadores SSR foram desenvolvidos e utilizados para saturar o mapa genético-molecular preliminar da espécie. O mapa genético atual foi construído com um total de 122 locos SSR, constituído por 294 marcas, das quais 133 foram introduzidas por meio dos novos SSR. Estas marcas foram distribuídas em 69 grupos de ligação (LGs), com tamanhos variando de 5,6cM a 135,5cM e cobertura de 3224,4cM. Os grupos de homologia (HGs) foram formados por marcadores contendo duas marcas ou mais ligadas ao mapa, estabelecendo, desta forma, a ligação entre os LGs. Seis HGs foram obtidos e dois LGs permaneceram não ligados. A fenotipagem para o modo de reprodução nos híbridos F1 possibilitou o mapeamento do caráter apomixia (apo-loco) no LG2 com distância de 23cM da marca Bh027.c.D2. Embora o novo mapa de U. humidicola conte com a inserção de novas marcas, este ainda necessita ser saturado com marcadores SNPs, possibilitando, assim, o aumento na densidade de marcadores no mapa, bem como a localização de marcas ligadas ao apo-loco e a outros caracteres de importância econômica

Abstract: Large areas of Brazil are destined for the cultivation of pasture, where the purpose is to feed cattle. These areas are occupied by various forage species, including the genus Urochloa, composed of some of the most planted species in the country, as the U. humidicola. The species is native to Africa and its main characteristics are tolerance to wetlands, the ability to resist well to heavy grazing and to acidic soils and is a hexaploid, reproducing by apomixis. A few decades ago, Embrapa started the breeding program in Urochloa, where currently many crossings have been performed in several species of the genus, including U. humidicola, where the commercial cultivar BRS Tupi was crossed with access H031, which is the only sexual genotype the Germplasm Bank of Embrapa, generating a population of 364 genotypes and 279 individuals were identified as F1 hybrids. These hybrids were used in the construction of a genetic map based on microsatellite markers, developed exclusively for the species. However, due to low map saturation, new SSR markers were developed and used to saturate the existing map. The current map was constructed with a total of 122 SSR loci, consisting of 294 markers, of which 133 were introduced by the present study. The markers were distributed in 69 linkage groups (LGs), with sizes ranging from 5,6cM to 135,5cM and with a total length of 3224,4cM. The homology groups (HGs) were formed by markers containing two or more bands linkage to the map, thereby establishing the connection between the LGs. Six HGs were obtained and two LGs remained unbound. A phenotyping for the reproduction mode was carried out in F1 hybrids and the results included in the map whose character apomixis (apo-locus) was mapped on LG2 with a distance of 23cM of Bh027.c.D2 marker. Although the new map U. humidicola is formed by the introduction of new markers, this still needs further saturated, including SNP markers, making possible to obtain a higher density map, the location bands link to the apo-locus and link to other characters of economic importance that may be mapped in the same
Subject: Urochloa humidicola
Plantas - Melhoramento genético
Híbridos
Apomixia
Repetições de microssatélites
Language: Multilíngua
Editor: [s.n.]
Citation: SANTOS, Jean Carlos de Souza. Saturação do mapa genético molecular de Urochloa humidicola = Saturation of molecular genetic map in Urochloa humidicola. 2015. 1 recurso online ( 198 p.). Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.repositorio.unicamp.br/handle/REPOSIP/316494>. Acesso em: 28 ago. 2018.
Date Issue: 2015
Appears in Collections:IB - Tese e Dissertação

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