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Type: DISSERTAÇÃO
Degree Level: Mestrado
Title: Análise do perfil de expressão dos genes TTF-1, FOXE1, PAX8 e DREAM em pacientes com nódulos tireoidianos
Title Alternative: Analysis of expression profile of TTF-1, FOXE1, PAX8 and DREAM genes in patients with thyroid nodules
Author: Batista, Fernando de Assis, 1990-
Advisor: Ward, Laura Sterian, 1956-
Abstract: Resumo: Nódulos de tireoide, benignos e malignos, tem se tornado cada vez mais frequentes, obrigando a busca de marcadores de diagnóstico e prognóstico. Três fatores de transcrição tireoide-específicos estão envolvidos na manutenção do estado diferenciado da glândula e em sua carcinogênese: TTF-1, FOXE1 e PAX8. Os níveis de expressão destes genes estão relacionados com o grau de diferenciação tecidual em tumores tireoidianos. O repressor transcricional DREAM também está envolvido na expressão gênica tireoide-específica através da interação com o gene da tireoglobulina e com os fatores de transcrição TTF-1, FOXE1 e PAX8. O aumento da expressão de DREAM na tireoide está relacionado com o aumento da glândula e desenvolvimento nodular. O objetivo do presente estudo foi analisar a expressão dos genes TTF-1, FOXE1, PAX8 e DREAM em tecidos tumorais benignos e malignos da tireoide, além de identificar possíveis mutações no gene DREAM em pacientes com nódulos tireoidianos. Para tanto foram coletadas 200 amostras de tecido nodular, sendo 50 adenomas foliculares (AF), 49 bócios nodulares, 63 carcinomas papilíferos clássicos (CPTC), 36 carcinomas papilíferos de variante folicular (CPTVF). Todos os pacientes foram submetidos a um mesmo protocolo padrão e acompanhados por 12-87 meses (38 ± 17 meses). Foram extraídos DNA e RNA de todas as amostras. A análise de expressão foi realizada por qPCR e a detecção de mutações no gene DREAM foi feita por sequenciamento automático. Os dados obtidos foram relacionados com dados clínicos e de evolução dos pacientes. Demonstramos que, embora a expressão de TTF-1 tenha sido similar entre os diferentes nódulos analisados (p=0.7056), FOXE1 (p<0,0001), PAX8(p<0,0001) e DREAM (p<0,0001) foram significativamente mais expressos em tecidos benignos (AF e bócio) do que em malignos (CPTC e CPTVF) identificando malignidade com 75,9%; 70,6%; e 75,3% de acurácia respectivamente.Os três genes foram ainda diferencialmente expressos entre as lesões de padrão folicular AF e CPTVF (FOXE1,p=0,0052; PAX8, p=0,0002; DREAM, p<0,0001), diferenciando estas lesões com 67,9%; 70,6%; e 71,6% de acurácia respectivamente. No entanto, a expressão dos genes investigados não se associou a características de agressividade tumoral ou de evolução. Embora não tenhamos encontrado nenhuma alteração em regiões codificantes do gene DREAM, pudemos observar a ocorrência de 6 alterações em áreas não codificantes próximas aos éxons. A alteração IVS-95T>A está localizada na região promotora e foi encontrada em apenas um paciente. As alterações IVS2-131C>T e IVS3+17T>C foram encontradas em regiões intrônicas (intron 1 e 3 respectivamente) em um paciente cada. As alterações IVS1+41C>G, IVS3+10G>C e IVS8-118C>T foram encontradas em vários pacientes por se tratarem de polimorfismos já descritos (rs2248415, rs117109173 e rs58372613 respectivamente). As frequências alélicas e genotípicas das alterações não se associaram as características clínicas, de agressividade ou evolução. Concluímos que a expressão dos genes FOXE1, PAX8 e DREAM pode auxiliar o diagnóstico de malignidade e a diferenciação de lesões tireoidianas, mas não possui utilidade como marcador de prognóstico. Além disso, mutações e polimorfismos do gene DREAM em pacientes com nódulos tireoidianos não possuem clínica como biomarcadores de diagnóstico ou prognóstico do CT

Abstract: Thyroid nodules, benign and malignant, have become increasingly frequent, impelling the search for markers for their diagnosis and prognosis. Three thyroid-specific transcription factors are involved in maintaining the differentiation of the gland and its carcinogenesis: TTF-1, FOXE1 and PAX8. The expression levels of these genes are related to the degree of tissue differentiation in thyroid tumors. The transcriptional repressor DREAM is also involved in thyroid-specific gene expression through interaction with the thyroglobulin gene and the transcription factors TTF-1, FOXE1 and PAX8. An increased expression of DREAM was related to the thyroid enlargement and nodular development. The purpose of this study was to analyze the expression of TTF-1, FOXE1, PAX8 and DREAM genes in benign and malignant thyroid tumor tissues and identify possible mutations in the DREAM gene in patients with thyroid nodules. For that purpose, we collected 200 thyroid nodules samples: 50 follicular adenomas (FA), 49 nodular goiters, 63 classic papillary carcinomas (CPTC), 36 follicular variant of papillary thyroid carcinomas (FVPTC). All patients were submitted to the same standard treatment protocol and followed by 12-87 months (38 ± 17 months). Gene expression analysis was performed by real time PCR and we performed automatic sequencing in order to detect mutations of DREAM gene. The data obtained were correlated to clinical and pathological features and to patients¿ outcomes. We demonstrated that FOXE1 (p<0.0001), PAX8 (p<0.0001) and DREAM (p<0.0001) genes¿ expression, but not TTF-1 (p=0.7056), were higher in benign (FA and goiter) than in malignant thyroid lesions (CPTC and FVPTC), being able to identify malignancy with an accuracy of 75.9%, 70.6% and 75.3%, respectively. The three genes were also differentially expressed between follicular lesions FA and FVPTC (FOXE1, p=0.0052; PAX8, p=0.0002; DREAM, p<0.0001), identifying these lesions with 67.9%, 70.6% and 71.6% accuracy respectively. However, the expression of the investigated genes was not associated with any feature of tumor aggressiveness or patients¿ outcome. Although we did not find genetic alterations in coding regions of DREAM gene, we observed the occurrence of 6 alterations in non-coding regions near the exons. The alteration IVS-95T> A is located in the promoter region of the gene and was found in one patient. The alterations IVS2-131C>T and IVS3+17T> C were found in intronic regions (introns 1 and 3 respectively), each in one patient. The alterations IVS1+41C>G, IVS3+10G>C and IVS8-118C>T, corresponding to already described polymorphisms (rs2248415, rs58372613 and rs117109173 respectively), were found in several patients. Allelic and genotypic frequencies of the alterations were not associated with any clinical or pathological feature of aggressiveness or with outcome. We conclude that the expression of FOXE1, PAX8 and DREAM may help diagnose thyroid nodules, identifying malignancy and characterizing follicular-patterned thyroid lesions, but is not useful as a prognostic marker. In addition, mutations and polymorphisms in non-coding regions of the DREAM gene in patients with thyroid nodules are not associated with clinical features, not having utility as diagnostic or prognosis biomarkers for TC
Subject: Neoplasias da glândula tireoide
Fatores de transcrição
Marcadores biológicos
Editor: [s.n.]
Citation: BATISTA, Fernando de Assis. Análise do perfil de expressão dos genes TTF-1, FOXE1, PAX8 e DREAM em pacientes com nódulos tireoidianos. 2015. 89 p. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.repositorio.unicamp.br/handle/REPOSIP/310297>. Acesso em: 27 ago. 2018.
Date Issue: 2015
Appears in Collections:FCM - Tese e Dissertação

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