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Type: TESE
Title: Biodonut : um sistema web open source com com visualização 2D e 3D para manipulação de clonagem em plasmídeos
Title Alternative: Biodonut : a web open source system with 2D and 3D visualization for plasmids cloning manipulation
Author: Palma, Eloá Carolina Nava Cardoso, 1987-
Advisor: Carvalho, Marco Antonio Garcia de, 1970-
Abstract: Resumo: O surgimento dos sequenciadores automáticos de DNA por volta dos anos 1990 fez com que a quantidade de sequências e informações a serem analisadas aumentasse exponencialmente. Sendo assim, os recursos computacionais são cada vez mais exigidos em diversas tarefas de armazenamento desses dados. Para atender essas e outras necessidades, surgiu a Bioinformática, que engloba diversas áreas como Ciência da Computação, Matemática, Estatística, e a Biologia Molecular. Neste trabalho, desenvolvemos um software denominado Biodonut, que consiste em manipular plasmídeos utilizando visualização 2D e 3D. Biodonut é um produto de software de plataforma web, open source para que os pesquisadores possam manipular plasmídeos in silico, visualizando em formato 2D e 3D e possibilitando uma análise diferenciada das áreas julgadas importantes. A base de dados utilizada no software é o GenBank, por ser mundialmente conhecida e respeitada. Uma comparação com dois importantes softwares da área foi efetuada e é apresentada neste trabalho. Os resultados apontam que usar Biodonut é vantajoso em relação os outros dois softwares

Abstract: The advent of automated DNA sequencers around 1990s led to the amount of information sequences to be analyzed and increased exponentially. Thus, computing resources are increasingly demanded in various tasks such data storage. To meet these and other needs arose Bioinformatics, encompassing diverse areas as Computer Science, Mathematics, Statistics, and Molecular Biology. In this work, we developed a software called Biodonut, which involves manipulating plasmids using 2D and 3D visualization. Biodonut is a product of web software platform, open source so that researchers can manipulate plasmids in silico, visualizing 2D and 3D format, enabling a differentiated analysis of the areas deemed important. The database software is used in GenBank, to be globally known and respected. A comparison with two important software of the area was conducted and is presented in this paper. The results show that using Biodonut is advantageous over the other two softwares
Subject: Clonagem
Plasmideos
In silico
Visualização
Modelagem 3D
Editor: [s.n.]
Date Issue: 2014
Appears in Collections:FT - Tese e Dissertação

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