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Type: Artigo de periódico
Title: A Structure-Activity Relationship (SAR) Study of Neolignan Compounds with Anti-schistosomiasis Activity
Author: Alves, Claúdio N.
Macedo, Luiz G. M. de
Honório, Káthia M.
Camargo, Ademir J.
Santos, Lourival S.
Jardim, Iselino N.
Barata, Lauro E. S.
Silva, Albérico B. F. da
Abstract: A set of eighteen neolignan derivative compounds with anti-schistosomiasis activity was studied by using the quantum mechanical semi-empirical method PM3 and other theoretical methods in order to calculate selected molecular properties (variables or descriptors) to be correlated to their biological activities. Exploratory data analysis (principal component analysis, PCA, and hierarchical cluster analysis, HCA), discriminant analysis (DA) and the Kth nearest neighbor (KNN) method were employed for obtaining possible relationships between the calculated descriptors and the biological activities studied and predicting the anti-schistosomiasis activity of new compounds from a test set. The molecular descriptors responsible for the separation between active and inactive compounds were: hydration energy (HE), molecular refractivity (MR) and charge on the C19 carbon atom (Q19). These descriptors give information on the kind of interaction that can occur between the compounds and their respective biological receptor. The prediction study was done with a new set of ten derivative compounds by using the PCA, HCA, DA and KNN methods and only five of them were predicted as active against schistosomiasis.
Um conjunto de dezoito compostos de neolignanas com atividade antiesquistossomose foi estudado com o método semi-empírico PM3 e outros métodos teóricos com o intuito de avaliar algumas propriedades (variáveis ou descritores) moleculares selecionadas e correlacioná-las com a atividade biológica. Análise exploratória dos dados (análise de componentes principais, PCA, e análise hierárquica de agrupamentos, HCA), análise discriminante (DA) e o método KNN foram utilizados na obtenção de possíveis correlações entre os descritores calculados e a atividade biológica em questão e na predição da atividade antiesquistossimose de algumas moléculas teste. Os descritores moleculares responsáveis pela separação entre os compostos ativos e inativos foram: energia de hidratação (HE), refratividade molecular (MR) e carga sobre o átomo C19 (Q19). Estes descritores fornecem informações a respeito do tipo de interação que pode ocorrer entre os compostos e seu respectivo receptor biológico. Após a construção do modelo para compostos ativos e inativos, os métodos PCA, HCA, DA e KNN foram empregados em um estudo de predição. Foram estudados 10 novos compostos e somente 5 deles foram classificados como ativos contra esquistossomose.
Subject: PM3
neolignans
anti-schistosomiasis
principal component analysis
hierarchical cluster analysis
discriminant analysis
Kth nearest neighbor
Editor: Sociedade Brasileira de Química
Rights: aberto
Identifier DOI: 10.1590/S0103-50532002000300003
Address: http://dx.doi.org/10.1590/S0103-50532002000300003
http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-50532002000300003
Date Issue: 1-Jun-2002
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