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Type: TESE DIGITAL
Degree Level: Doutorado
Title: Mapeamento genético-molecular e análise de QTLs associados ao crescimento em Hevea brasiliensis utlizando marcadores microssatélites e SNPs = Genetic mapping and QTL analysis of growth-related traits in Hevea brasiliensis using microsatellite and SNP markers
Title Alternative: Genetic mapping and QTL analysis of growth-related traits in Hevea brasiliensis using microsatellite and SNP markers
Author: Conson, André Ricardo Oliveira, 1987-
Advisor: Souza, Anete Pereira de, 1962-
Abstract: Resumo: O aspecto emblemático que a seringueira sugere quando se trata de produção de borracha natural no Brasil, é limitado atualmente devido, principalmente, a ausência de clones resistentes a doença chamada mal-das-folhas, causada pelo fungo Microcyclus ulei. Clones adaptados a "áreas de escape", onde níveis epidêmicos da doença não são observados, podem ser uma alternativa para contornar problemas relacionados às condições climáticas desfavoráveis ao crescimento e produção de látex. O uso de ferramentas da biologia molecular pode ajudar na identificação de locos que controlam características quantitativas (QTLs), sobretudo a partir do desenvolvimento das tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS). Foi desenvolvido na presente tese um mapa genético para uma população F1 segregante (GT1 e RRIM701), onde medidas fenotípicas de diâmetro foram obtidas em diferentes idades de crescimento (12 meses, 17 meses, 22 meses, 28 meses e 35 meses), para a detecção de QTLs relacionados ao crescimento e vigor das plantas. A partir da abordagem de genotipagem por sequenciamento (GBS), foi possível selecionar 2.998 SNPs utilizando diferentes parâmetros de filtragem. Um total de 1.082 marcadores SSRs e SNPs foram mapeados, sendo 671 SNPs oriundos de GBS. Os marcadores foram distribuídos em 18 grupos de ligação e cobriram um total de 3.779,7 cM, com uma densidade de 1 marcador a cada 3,49 cM. A genotipagem de marcadores SNP através da técnica de GBS contribuiu para o aumento da densidade de marcadores, em especial em regiões onde se observava uma quantidade reduzida de marcadores SSRs. Foram detectados 19 QTLs relacionados ao diâmetro de caule em cinco épocas de crescimento avaliadas durante as estações de verão e inverno. Também foi possível observar efeitos aditivos e de dominância dos QTLs com diversos padrões de segregação auxiliando no maior entendimento da arquitetura genética de caracteres quantitativos, possibilitando novo direcionamento para o melhoramento genético da seringueira

Abstract: The symbolic aspect that rubber tree suggests by the natural rubber production in Brazil is currently limited, mainly due the lack of resistant clones to the South America Leaf Blight disease, caused by the fungus Microcyclus ulei. Clones adapted to the so-called "escape regions", where epidemic levels of disease is not observed, may be an alternative to overcome problems related to unfavorable climatic conditions for growth and latex production. Molecular biology tools usage can help to identify loci controlling quantitative traits (QTL), especially with the development of next generation sequencing technologies. It was developed in this thesis a genetic map for a full-sib population (GT1 and RRIM701) with phenotypic measures for diameter made at different growth ages (12 months, 17 months, 22 months, 28 months and 35 months) to detect QTL related to plant-growth and vigor. From the genotyping by sequencing approach (GBS), it was possible to detect 2,998 SNPs using different filtering parameters. A total of 1,082 SSR and SNP markers were mapped, with 671 SNPs from GBS. The markers were distributed into 18 linkage groups and covered a total of 3,779.7 cM with a marker density of 3.49 cM. SNP genotyping using the GBS contributed to increase marker density, especially in regions where it was observed a reduced quantity of SSR markers. We detected 19 QTL related to stem diameter at five growth periods evaluated during summer and winter seasons. It was also observed additive and dominance effects for QTL with different patterns of segregation that helps better understand the genetic architecture of quantitative traits, thus enabling new directions to genetic breeding of rubber tree
Subject: Seringueira
Hevea
Mapeamento cromossômico
Mapeamento de QTL
Marcadores moleculares
Editor: [s.n.]
Citation: CONSON, André Ricardo Oliveira. Mapeamento genético-molecular e análise de QTLs associados ao crescimento em Hevea brasiliensis utlizando marcadores microssatélites e SNPs = Genetic mapping and QTL analysis of growth-related traits in Hevea brasiliensis using microsatellite and SNP markers. 2016. 1 recurso online (104 p.). Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.repositorio.unicamp.br/handle/REPOSIP/331179>. Acesso em: 1 set. 2018.
Date Issue: 2016
Appears in Collections:IB - Tese e Dissertação

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